Ekzokrin ve endokrin bozukluklar ve yetersizlikler, kronik pankreatitte (CP) iki önemli zararlı patolojik süreçtir ve steatore ve diyabete yol açabilir. Bununla birlikte, CP’de ekzokrin ve endokrin bozuklukların şiddetini değerlendirmek için güvenilir klinik sınıflandırma şemaları eksiktir ve altta yatan mekanizmalar da belirsizdir. Özellikle, CP’de ekzosom bazlı sıvı biyopsi ve sınıflandırma eksiktir. Bu çalışmada, farklı CP şiddet derecelerine sahip CP hastalarından alınan plazma eksozomlarında transkriptom dizilemesi gerçekleştirdik. Ayrıca, sınıflandırmayı yorumlamak için CP hastalarındaki pankreas lezyonlarından alınan tek hücreli dizileme verilerini analiz ettik ve sınıflandırmayı doğrulamak için harici bir kohort oluşturuldu.

SOYUT

Hastalıkla ilişkili genlerdeki amino asit değişimlerinin yapısal ve işlevsel etkisini etkileyen temel faktörlerden biri, arka plandaki genetik varyasyondur. Aynı gendeki birlikte evrimleşen pozisyonlar arasındaki epistatik etkileşimler, her bir bölgenin etkileşimde bulunduğu ortaklarla karşılıklı bağımlılığına yol açar. Bu etkileşimlerin rolünü destekleyen kanıtlar, insan dışı türlerin genomunda insan hastalıklarıyla ilişkili alellerin ortaya çıkmasıyla örneklendirilmiştir. Bu olguya çeşitli açıklamalar katkıda bulunabilse de, bir olasılık, patojenik etkiyi tamamen veya kısmen geri kazandırabilen ve protein yapısının ve düzgün işlevinin korunmasına katkıda bulunan telafi edici etkileşimli bölgelerin ortaya çıkmasıdır. Bu etkileşimler, burada belirli proteinler için literatür verilerinin analizi yoluyla yeniden ele alınan genetik bağlamlar yaratır; özellikle de doğuştan metabolizma hatalarında rol oynayan proteinlere odaklanır.