Gen terapilerini düşük gelirli ülkelerde üreterek daha erişilebilir hale getirin!

Gen tedavileri, ancak dünyanın en çok ihtiyaç duyulan bölgelerinde geliştirilip üretilirse her yerde daha uygun fiyatlı hale gelecektir.

Hindistan’daki bir sağlık merkezindeki eczacı, orak hücre hastalığı olan bir kişiye ücretsiz ilaç dağıtıyor. Kredi: Rafiq Maqbool / AP Photo / Alamy

Geçen Kasım ayında Birleşik Krallık, orak hücre hastalığının tedavisi için CRISPR gen düzenleme teknolojisine dayanan Casgevy adlı bir terapinin kullanımına izin veren ilk ülke oldu. Birkaç hafta içinde, diğer üç ülke – Amerika Birleşik Devletleri, Bahreyn ve Suudi Arabistan – aynı şeyi yaptı. Aralık 2023’te Amerika Birleşik Devletleri, hastalığı tedavi etmek için başka bir gen terapisi olan Lyfgenia’nın kullanımını da onayladı.

Orak hücre hastalığı dünya çapında her yıl yaklaşık 400.000 kişiyi öldürüyor. Kırmızı kan hücrelerinin orak şeklinde olmasına ve kan damarlarını tıkamasına neden olur, bu da diğer sorunların yanı sıra ciddi ağrı ve doku hasarına neden olabilir1. Dünyadaki en yaygın kalıtsal bozukluklardan biri olan hastalığa sahip kişilerin %75’inden fazlası Sahra altı Afrika ve Hindistan’da doğmaktadır. Büyük hastalıklardan kaynaklanan ölüm ve sakatlığı değerlendirmeye yönelik bölgesel ve küresel bir çaba olan 2021 Küresel Hastalık Yükü Çalışması, beş yaşın altındaki çocuklarda küresel olarak 12. önde gelen ölüm nedeni olduğunu ortaya koydu1. Afrika’da orak hücre hastalığı teşhisi konan bebeklerin veya çocukların% 50’sinden fazlası beş yaşından önce ölüyor2.

Gen terapilerinin ortaya çıkışına kadar, tek tedavi kemik iliği nakliydi. Bu, sağlıklı bir donör bulmayı ve ardından haftalar boyunca invaziv tedaviyi gerektirir3.

Tüm bunlar göz önüne alındığında, iki gen terapisi için düzenleyici onay almak olağanüstü bir başarıdır. Yine de, tedavi başına sırasıyla 2.2 milyon ABD Doları ve 3.1 milyon ABD Doları tutarındaki fiyatlarla, Casgevy (exaxamglogene autotemcel) ve Lyfgenia (lovotibeglogene autotemcel), risk, her ikisinin de piyasadan çekilmesidir, çünkü çok az insan veya sağlık sistemi bunları karşılayabilir.

Bu, β-talasemi için Zynteglo (betibeglogene autotemcel) adı verilen ilgili bir tedavi de dahil olmak üzere diğer dört gen terapisi için zaten olmuştur. Bir başka kalıtsal kan hastalığı olan β-talasemi, küresel nüfusun yaklaşık% 3’ünde anemi, yorgunluk ve halsizliğe neden olur, ancak Afrika, Orta Doğu ve güneydoğu Asya gibi bölgelerde görülme sıklığı %20’ye ulaşabilir4. 2021’de Zynteglo, geliştiricisi Somerville, Massachusetts merkezli ilaç şirketi Bluebird Bio’nun Birleşik Krallık Ulusal Sağlık ve Bakım Mükemmelliği Enstitüsü (NICE) gibi kamu kurumlarını onaylamaya ikna edememesinin ardından Avrupa pazarından çekildi. Zynteglo’nun tedavi başına maliyeti 1.8 milyon dolar.

Araştırmacılar, ilaç geliştiricileri ve ilaç üreticileri, gen terapilerini dünya için dönüştürücü olmak şöyle dursun, daha zengin ülkelerde bile uygulanabilir hale getirme şansını boşa harcıyorlar. Fırsatı değerlendirmek için, en çok ihtiyacı olan popülasyonları ve tedaviler için küresel pazarı hesaba katmalıdırlar – hem ilaçları geliştirirken hem de değerlendirirken. Bu, klinik araştırmalara kimlerin kaydolduğunu ve bu araştırmaların nerede yürütüldüğünü yeniden gözden geçirmek anlamına gelir. Aynı zamanda, düşük ve orta gelirli ülkelerle (LMIC’ler) ortaklık kurmak ve onlara en çok ihtiyaç duyan ülkelerde gen terapilerinin geliştirilmesini ve üretimini kolaylaştırmak anlamına gelir.

Gen terapilerini düşük gelirli ülkelerde üreterek daha erişilebilir hale getirin (nature.com): Gen terapilerini düşük gelirli ülkelerde üreterek daha erişilebilir hale getirin!

İnsan ve Biyoinformatik

Biyolojik sistemler ve olaylar hakkında toplanan bilgilerin sağlıklı biçimde değerlendirilmesi;
biyoloji yanında biyokimya, kimya ve tıp ile bilişim bilimleri, matematik ve istatistiğin
birleştirilmesi sonucu doğan yeni ve disiplinler arası bir bilim dalı olan biyoinformatik
sayesinde mümkündür. Biyoinformatik, biyolojik verinin işlenmesinde ve biyolojik
problemlerin çözümünde bilişim teknolojilerinin kullanılması esasına dayanmaktadır, ayrıca
biyolojik olayların moleküler düzeyde açıklanmasına da yardımcı olmaktadır. İnsan genomu
proje sonuçlarının 2001’de yayınlanması, biyoinformatiği multidisipliner bir bilim dalı haline
getirmiştir (Hogue, 2002). Biyoinformatiğin en temel hedefi, genetik kodumuzun yazılı olduğu
DNA’daki nükleotid diziliminden yola çıkarak hastalıklara sebep olan mekanizmayı anlamaya
çalışmak ve bu doğrultuda tedavi yöntemlerinin gelişimine katkı sağlamaktır.
Neden DNA’ya odaklanıyoruz? Vücudumuzda her biri kendine özgü işlevlere sahip organların
olduğunu hatırlayın. Organlar dokulardan oluşur. Dokular, benzer işlevleri yerine getiren
benzer türde hücre kümeleridir. Bu nedenle, hücrelerle çalışmak kolay ve ekonomiktir çünkü
bunlar organizmalardan daha basittirler, fakat yine de genetik olarak yeterince karmaşık kodlara
sahiplerdir. Hücreleri bir Petri kabına aktarıp uygun ortamları sağladığımız zaman gelişmiş
organizmalara kıyasla daha hızlı ve kolay büyüyebilir, çoğalabilirler. Her canlı tek bir hücre
olarak yaşamına başlar ve ebeveynlerinin fenotiplerinin çoğunu miras alır.

https://www.researchgate.net/profile/Tahir-Atici/publication/347899077_Insan_ve_Biyoinformatik/links/649471098de7ed28ba4ca9d8/Insan-ve-Biyoinformatik.pdf

Multidisipliner Yeni Bir Bilim Dalı: Biyoinformatik ve Tıpta Uygulamaları

https://prezi.com/p/70qeujo9ecda/biyoinformatik/

Biyolojik sistemler ve olaylar hakkında toplanan bilgilerin sağlıklı biçimde değerlendirilmesi; biyoloji yanında biyokimya, kimya ve tıp ile bilişim bilimleri, matematik ve istatistiğin entegrasyonunun sonucu doğan yeni ve interdisipliner bir bilim dalı olan biyoinformatik sayesinde mümkündür. Biyoinformatik, problemlerin çözümünde teknolojilerinin kullanılması esasına göre araştırmaların sonuçlarının ve araştırmaların çeşitliliğinin belirlenmesine yardımcı olur. Biyoinformatik, biyolojik bilgilerin yaratılması ve verilerinin saklanması için kullanılan araçtır.
Biyologmatik, tıbbi bilimlerde çok önemli bir rol Medikal bilimlerde son yıllardaki uygulamaların genel ekspresyon analizleri üzerine yoğunlaşmıştır. Genellikle farklı hastalıklardan etkilenen müşterilerin dinamikleri derlenerek, sağlıklı şirketlerinki ile karşılaştırılarak ve farklılıklardan hastalık güvenlik ve hedef ilaç tasarımına geçilmektedir. Bu sayede ekspresyona ulaşan proteine ​​erişilebilen noktaların tasarımı ve daha da önemlisi ekspresyon seviyesinde değişime neden olan transkripsiyon regülatörünün değişmesini sağlar. Bu bağlamda, ortamda mikro-dizi deneyleri gerçekleştirilerek, farmakolojik uygulamalarda cevabın değerlendirilmesi ve test edilmesi istenen toksikoloji verilerinin tahmininde ön bilgi edinilmesi söz konusudur.
Bu Makalede oldukça yeni bir bilim dalı olan biyoinformatikin tıpta ve farmakolojide kullanımı açıklanmaya çalışılmıştır.

Anahtar Kelimeler : Biyoinformatik, İlaç Dizaynı, Genomik.

Özet

Yeni bir çok disiplinli bilimsel dal: Biyoinformatik ve tıptaki uygulamaları

Biyolojik olarak toplanan bilgilerin sağlıklı bir şekilde değerlendirilmesi sistemler ve olaylar, tıp, biyokimya, kimya, bilişim, matematik ve istatistik ile biyolojinin birleştirilmesinden doğan yeni ve disiplinler arası bir bilim dalı olan biyoenformatik sayesinde mümkündür. Biyoenformatik, bilişim teknolojilerinden yararlanarak sorunları çözmek için temel alır. biyolojik problemler ve biyolojik olayların moleküler düzeyde açıklanmasına yardımcı olur. Biyoenformatik, biyolojik bilgi oluşturmak ve depolamak için veritabanlarının oluşturulmasıdır.
Biyoenformatik tıp bilimlerinde önemli bir rol oynar. Tıp bilimlerindeki son uygulamalar gen ifadesi analizlerine odaklanmıştır. Genel olarak, farklı hastalıklardan etkilenen hücrelerin ifadeleri derlenerek sağlıklı hücrelerin ifadeleriyle karşılaştırılır ve aralarındaki farklar hastalığı teşhis etmek ve hedef ilacı tasarlamak için kullanılır. Bu sayede, ifadeye konu olan proteine ​​bağlanabilecek bileşenler tasarlanabilir ve dahası, ifade düzeyinde değişikliğe neden olan transkripsiyon düzenleyiciler belirlenebilir. Bu bağlamda, mikro-dizi deneylerinin yapılması ve farmakolojik uygulamalarda yanıtın değerlendirilmesi, böylece test edilecek ilaçların toksisitesi hakkında ön bilgi edinilmesi söz konusudur. Bu derlemede,
çok yeni bir bilim dalı olan biyoenformatiğin tıp ve farmakolojideki kullanımını açıklamaya çalıştık.

İlk kez bir çocuğun başına epilepsi cihazı yerleştirildi: ‘Artık gelecek daha parlak’

İngiltere’de epilepsi hastası bir çocuğun kafatasına nöbetleri kontrol altına almak için yeni bir cihaz yerleştirildi. 13 yaşındaki Oran Knowlson, dünyada bu yöntemin denendiği ilk hasta oldu

Beyninin derinliklerine elektrik sinyalleri gönderen nörostimülatör, çocuğun gündüz nöbetlerini yüzde 80 oranında azalttı.
Oran Knowlson’un annesi Justine Knowlson, BBC’ye onun daha mutlu olduğunu ve “çok daha iyi bir yaşam kalitesine” sahip olduğunu söyledi.
Ameliyat, Oran Londra’daki Great Ormond Street Hastanesi’nde yapılan denemenin bir parçası olarak geçtiğimiz Ekim ayında gerçekleştirildi. Oran, 3 yaşındayken başlayan, tedaviye dirençli bir epilepsi türü olan Lennox-Gastaut sendromuna sahip.

https://www.bbc.com/turkce/articles/cprrre33x4wo

Kendi kendini iyileştirebilen elastomerler tasarlamak için birleşik bir parametre olarak cam geçiş sıcaklığı

Malzemelerin, özellikle polimerlerin kendi kendini iyileştirme yeteneği, fonksiyonel stabilitelerini ve ömürlerini iyileştirir. Bugüne kadar, kendi kendini iyileştirebilen polimerler için tasarımlar, belirli moleküller arası etkileşimlere veya kimyalara dayanıyordu. Cam geçişine dayalı kendi kendini iyileştirebilen polimerler için bir tasarım metodolojisi rapor ediyoruz. Farklı cam geçiş sıcaklıklarına sahip iki monomerin istatistiksel kopolimer serileri (Tg) sentezlendi ve kendi kendini iyileştirme eğilimleri T’ye bağlıydı.g kopolimerlerin ve bileşenlerinin. Kendi kendini iyileştirme, T’deki fark olduğunda daha verimli bir şekilde gerçekleşir.g iki monomer birimi arasında, dar bir T içinde daha büyüktür. g fonksiyonel gruplarından bağımsız olarak kopolimerlerin aralığı. Kendi kendini iyileştirebilen kopolimerler elastomerik ve polar değildir. Cam geçişini kendi kendini iyileştirmeye aşılama stratejisi, polimer tasarımının kapsamını genişletecektir.

Şekil 1. Cam geçişine dayalı kendi kendini iyileştirebilen polimerler için tasarım metodolojisi.
(A) Polimerlerin kendi kendini iyileştirmesi iki faktörle gerçekleşir: zincirler arası etkileşim ve zincir hareketliliği. (B) İki faktör, cam geçiş sıcaklığı (Tg) kopolimerler ve bileşenleri. (C) Birinin yüksek T’ye sahip olduğu iki tip akrilat monomer birimine sahip istatistiksel kopolimerler g etkileşim enerjisini depolayan (olarak adlandırılır)

Kendi kendini onaran malzemeler, orijinal işlevselliklerini korumak ve ömürlerini uzatmak için büyük avantajlara sahiptir (12). Polimerlerin viskoelastik yapısı, polimer ağlarının elastik enerjiyi geri yükleyebildiği veya dış yük altında akabildiği, mekanik hasardan kendi kendini iyileştirmelerini güçlendirir (34). Potansiyel, on yıllar boyunca kendi kendini iyileştirebilen polimerlerin geliştirilmesine yönelik yoğun çalışmalara yol açmıştır (5).

Kendi kendini iyileştirmek için, polimer zincirleri yeterli hareketlilik ve zincirler arası etkileşimler gerektirir (Şekil 1A) (5). Bu nedenle, birçok çalışma, hidrojen bağı (6-12), konak-konuk kimyası (1314), metal-ligand koordinasyonları (15-18), iyonik (19-22), hidrofobik (23), iyon-dipol (2425), π-π (2627), van der Waals (28) ve dipol-dipol etkileşimleri (2930), esnek polimer ağlara veya jellere (plastikleştirilmiş ağlar). Dinamik kovalent bağlar (31-33) veya sert-yumuşak çok fazlı (3435) da kendi kendini iyileştirme için polimer ağlarına dahil edilmiştir.

Kendi kendini onaran malzemeler, orijinal işlevselliklerini korumak ve ömürlerini uzatmak için büyük avantajlara sahiptir (12). Polimerlerin viskoelastik yapısı, polimer ağlarının elastik enerjiyi geri yükleyebildiği veya dış yük altında akabildiği, mekanik hasardan kendi kendini iyileştirmelerini güçlendirir (34). Potansiyel, on yıllar boyunca kendi kendini iyileştirebilen polimerlerin geliştirilmesine yönelik yoğun çalışmalara yol açmıştır (5).

Kendi kendini iyileştirmek için, polimer zincirleri yeterli hareketlilik ve zincirler arası etkileşimler gerektirir (Şekil 1A) (5). Bu nedenle, birçok çalışma, hidrojen bağı (6-12), konak-konuk kimyası (1314), metal-ligand koordinasyonları (15-18), iyonik (19-22), hidrofobik (23), iyon-dipol (2425), π-π (2627), van der Waals (28) ve dipol-dipol etkileşimleri (2930), esnek polimer ağlara veya jellere (plastikleştirilmiş ağlar). Dinamik kovalent bağlar (31-33) veya sert-yumuşak çok fazlı (3435) da kendi kendini iyileştirme için polimer ağlarına dahil edilmiştir.

Kendi kendini iyileştirebilen elastomerler tasarlamak için birleşik bir parametre olarak cam geçiş sıcaklığı | Bilimsel Gelişmeler (science.org): Kendi kendini iyileştirebilen elastomerler tasarlamak için birleşik bir parametre olarak cam geçiş sıcaklığı https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adp0729

Hedeflenen genom düzenleme, bir insan mikroRNA mutasyonunun neden olduğu ilerleyici işitme kaybı olan yetişkin farelerde işitsel işlevi geri kazandırır

İç saç hücrelerinde eksprese edilen bir mikroRNA olan MIR96’daki mutasyonlar, sendromik olmayan bir işitme kaybı şekli olan otozomal dominant sağırlık-50 (DFNA50) ile sonuçlanır. Burada, Zhu ve ark. MIR96’daki mutasyonları spesifik olarak silmek için bir CRISPR-Cas9 sistemini optimize etti ve bu düzenleme sisteminin adeno-ilişkili virüsün (AAV) insan mutasyonlarından birini (14C>A mutasyonu) taşıyan presemptomatik ve semptomatik farelerin koklealarına verilmesinin saç hücresi sağkalımını desteklediğini ve uzun vadede işitmeyi iyileştirdiğini gösterdi. Bu sonuçlar, mikroRNA düzenlemesinin DFNA50’li hastalarda işitsel işlevi korumak için umut verici bir strateji olabileceğini düşündürmektedir. —Daniela Neuhofer

Hedeflenen genom düzenleme, bir insan mikroRNA mutasyonunun neden olduğu ilerleyici işitme kaybı olan yetişkin farelerde işitsel işlevi geri kazandırır | Bilim Translasyonel Tıp (science.org): Hedeflenen genom düzenleme, bir insan mikroRNA mutasyonunun neden olduğu ilerleyici işitme kaybı olan yetişkin farelerde işitsel işlevi geri kazandırır

Ciddi hatalar, biyolojinin beygir gücü olan DNA aracının başına bela oluyor

Araştırmacılar laboratuvar yapımı binlerce plazmiti analiz ettiler ve bunların neredeyse yarısının kusurları olduğunu keşfettiler ve bu da deneysel tekrarlanabilirlik sorularını gündeme getirdi.

Plazmitler (burada çeşitli genlerin vurgulandığı renkli bir transmisyon elektron mikrografında gösterilmiştir) biyoloji laboratuvarlarında kullanılan dairesel DNA yapılarıdır.

Modern biyolojinin bir beygir gücü olan laboratuvar yapımı plazmitlerin sorunları var. Araştırmacılar, laboratuvarlarda üretilen 2.500’den fazla plazmiti analiz ederek dairesel DNA yapılarının sistematik bir değerlendirmesini yaptılar ve virüslerin içindeki yapıları gen terapisi olarak kullanabilmeleri için paketlemek gibi hizmetler sunan bir şirkete gönderdiler. Ekip, plazmitlerin neredeyse yarısının, terapötik bir geni ifade etmek için çok önemli olan dizilerdeki hatalar da dahil olmak üzere tasarım kusurlarına sahip olduğunu buldu. Araştırmacılar bulgularını geçen ay akran incelemesinden önce ön baskı sunucusu bioRxiv’e gönderdiler.
Portland’daki Oregon Sağlık ve Bilim Üniversitesi’nde genetikçi olan Hiroyuki Nakai, çalışmanın laboratuvarda plazmitler üzerinde uygun kalite kontrolünün nasıl yapılacağına dair “bilgi eksikliğine” ışık tuttuğunu söylüyor. Laboratuar yapımı plazmitlerle ilgili sorunların zaten farkındaydı, ancak çalışmanın ortaya çıkardığı hataların sıklığı karşısında şaşırdı. Muhtemelen, plazmit tasarımındaki hatalar nedeniyle sonuçların tekrarlanamadığı yayınlanmış birçok bilimsel makale vardır.

Ciddi hatalar, biyolojinin beygir gücü olan DNA aracının başına bela oluyor (nature.com): Ciddi hatalar, biyolojinin beygir gücü olan DNA aracının başına bela oluyor