Ciddi hatalar, biyolojinin beygir gücü olan DNA aracının başına bela oluyor

Araştırmacılar laboratuvar yapımı binlerce plazmiti analiz ettiler ve bunların neredeyse yarısının kusurları olduğunu keşfettiler ve bu da deneysel tekrarlanabilirlik sorularını gündeme getirdi.

Plazmitler (burada çeşitli genlerin vurgulandığı renkli bir transmisyon elektron mikrografında gösterilmiştir) biyoloji laboratuvarlarında kullanılan dairesel DNA yapılarıdır.

Modern biyolojinin bir beygir gücü olan laboratuvar yapımı plazmitlerin sorunları var. Araştırmacılar, laboratuvarlarda üretilen 2.500’den fazla plazmiti analiz ederek dairesel DNA yapılarının sistematik bir değerlendirmesini yaptılar ve virüslerin içindeki yapıları gen terapisi olarak kullanabilmeleri için paketlemek gibi hizmetler sunan bir şirkete gönderdiler. Ekip, plazmitlerin neredeyse yarısının, terapötik bir geni ifade etmek için çok önemli olan dizilerdeki hatalar da dahil olmak üzere tasarım kusurlarına sahip olduğunu buldu. Araştırmacılar bulgularını geçen ay akran incelemesinden önce ön baskı sunucusu bioRxiv’e gönderdiler.
Portland’daki Oregon Sağlık ve Bilim Üniversitesi’nde genetikçi olan Hiroyuki Nakai, çalışmanın laboratuvarda plazmitler üzerinde uygun kalite kontrolünün nasıl yapılacağına dair “bilgi eksikliğine” ışık tuttuğunu söylüyor. Laboratuar yapımı plazmitlerle ilgili sorunların zaten farkındaydı, ancak çalışmanın ortaya çıkardığı hataların sıklığı karşısında şaşırdı. Muhtemelen, plazmit tasarımındaki hatalar nedeniyle sonuçların tekrarlanamadığı yayınlanmış birçok bilimsel makale vardır.

Ciddi hatalar, biyolojinin beygir gücü olan DNA aracının başına bela oluyor (nature.com): Ciddi hatalar, biyolojinin beygir gücü olan DNA aracının başına bela oluyor