Eski insan beyninin yeni arşivi, yumuşak dokuların korunmasına ilişkin yanlış anlamalara meydan okuyor…

Yeni bir çalışma, arkeolojik kayıtlarda beynin korunmasının son derece nadir olduğu yönündeki önceden kabul edilen görüşlere meydan okudu. Ekip, korunmuş insan beyinlerinden oluşan yeni bir arşiv derledi; bu arşiv, sinir dokularının, çürümeyi önleyen koşulların da yardımıyla, aslında geleneksel olarak düşünülenden çok daha fazla miktarda varlığını sürdürdüğünü vurguladı.

Jeolojik kayıtlarda yumuşak dokuların korunması nispeten nadirdir ve kasıtlı müdahalelerin çürüme sürecini durdurduğu durumlar (mumyalama veya dondurma gibi) dışında, organların tamamının hayatta kalması özellikle alışılmadık bir durumdur. Beynin başka yumuşak dokuların yokluğunda kendiliğinden korunması, yani beynin iskeletleşmiş kalıntılar arasında hayatta kalması, tarihsel olarak ‘türünün tek’ bir fenomeni olarak kabul edildi.
Oxford Üniversitesi’ndeki araştırmacılar tarafından lisansüstü araştırmacı Alexandra Morton-Hayward (Oxford Yer Bilimleri Bölümü) liderliğinde yürütülen yeni bir çalışma, arkeolojik kayıtlarda beynin korunmasının son derece nadir olduğu yönündeki daha önce kabul edilen görüşlere meydan okudu. Ekip, korunmuş insan beyinlerinden oluşan yeni bir arşiv derledi; bu arşiv, sinir dokularının, çürümeyi önleyen koşulların da yardımıyla, aslında geleneksel olarak düşünülenden çok daha fazla miktarda varlığını sürdürdüğünü vurguladı. Ondan fazla dildeki kaynak materyalden yararlanan bu küresel arşiv, bugüne kadar arkeolojik literatürün en büyük, en eksiksiz çalışmasını temsil ediyor ve daha önce derlenen beyin sayısının 20 katını aşıyor.

Devamını oku: Eski insan beyninin yeni arşivi, yumuşak dokuların korunmasına ilişkin yanlış anlamalara meydan okuyor…

https://www.sciencedaily.com/releases/2024/03/240320122455.htm

Yeni görüntüleme yöntemi oksijenin beyindeki yolculuğunu aydınlatıyor…

Yeni bir biyolüminesans görüntüleme tekniği, farelerin beynindeki oksijenin hareketinin son derece ayrıntılı ve görsel olarak çarpıcı görüntülerini oluşturdu. Diğer laboratuvarlar tarafından kolayca kopyalanabilecek yöntem, araştırmacıların felç veya kalp krizi sırasında meydana gelen beyne oksijen verilmemesi gibi beyindeki hipoksi biçimlerini daha kesin bir şekilde incelemesine olanak tanıyacak. Yeni araştırma aracı, hareketsiz bir yaşam tarzının neden Alzheimer gibi hastalıklara yakalanma riskini artırabileceğine dair fikir veriyor.

İnsan beyni, neredeyse tamamı oksijen gerektiren bir metabolizma türünden üretilen çok büyük miktarda enerji tüketir. Oksijenin verimli ve zamanında verilmesinin sağlıklı beyin fonksiyonu için kritik olduğu bilinmesine rağmen, bu sürecin kesin mekaniği büyük ölçüde bilim adamlarından gizlenmiştir.

Bugün Science dergisinde açıklanan yeni bir biyolüminesans görüntüleme tekniği, 
farelerin beynindeki oksijen hareketinin son derece ayrıntılı ve görsel olarak çarpıcı görüntülerini oluşturdu. Diğer laboratuvarlar tarafından kolayca kopyalanabilecek yöntem, araştırmacıların felç veya kalp krizi sırasında meydana gelen beyne oksijen verilmemesi gibi beyindeki hipoksi biçimlerini daha kesin bir şekilde incelemesine olanak tanıyacak. Yeni araştırma aracı, hareketsiz bir yaşam tarzının neden Alzheimer gibi hastalıklara yakalanma riskini artırabileceğine dair fikir veriyor.
Rochester Üniversitesi’nde bulunan Translasyonel Nörotıp Merkezi’nin (CTN) eş direktörü Maiken Nedergaard, “Bu araştırma, oksijen konsantrasyonundaki değişiklikleri sürekli olarak ve beynin geniş bir alanında izleyebildiğimizi gösteriyor” dedi. Kopenhag Üniversitesi. “Bu bize beyinde gerçek zamanlı olarak neler olduğuna dair daha ayrıntılı bir resim sağlıyor ve nörolojik bozuklukları tetikleyebilecek kan akışındaki değişiklikleri yansıtan, daha önce tespit edilmemiş geçici hipoksi alanlarını tanımlamamıza olanak tanıyor.”
Yeni yöntem, ateşböceklerinde bulunan biyolüminesans proteinlerin kimyasal kuzenleri olan ışıldayan proteinleri kullanıyor. Kanser araştırmalarında kullanılan bu proteinler, hücrelere enzim formunda ışıldayan bir protein üretmeleri için talimatlar veren bir virüs kullanır. Enzim, furimazin adı verilen bir substrat olan ikinci bir kimyasal bileşikle karşılaştığında, kimyasal reaksiyon ışık üretir.

Devamını oku: Yeni görüntüleme yöntemi oksijenin beyindeki yolculuğunu aydınlatıyor…

https://www.sciencedaily.com/releases/2024/03/240328162557.htm

Bilim insanları, yüzyıllar boyunca değişen insan beslenmesinin etkisini aydınlatmak için 4.000 yıllık dişlerden genetik sırlar çıkarıyor

Araştırmacılar, İrlanda’daki bir kireçtaşı mağarasında bulunan ve 4.000 yıl öncesine ait iki dişten olağanüstü derecede korunmuş mikrobiyomlar elde ettiler. Bu mikrobiyomların genetik analizleri, Bronz Çağı’ndan günümüze ağız mikroçevresindeki büyük değişiklikleri ortaya koymaktadır. Dişler hem aynı erkeğe aitti hem de ağız sağlığının anlık görüntüsünü sağlıyordu.

Atlantik Teknoloji Üniversitesi ve Edinburgh Üniversitesi’nden arkeologlarla işbirliği içinde yürütülen çalışma, bugün 
Moleküler Biyoloji ve Evrim dergisinde yayınlandı . Yazarlar diş eti hastalığına bağlı çeşitli bakterileri tanımladılar ve 
diş çürümesinin ardındaki ana suçlu olan 
Streptococcus mutans’ın ilk yüksek kaliteli antik genomunu sağladılar.
S. mutans modern ağızlarda çok yaygın olmasına rağmen 
antik genom kayıtlarında son derece nadirdir. Bunun bir nedeni türün asit üreten doğası olabilir. Bu asit dişi çürütür, aynı zamanda DNA’yı da yok eder ve plağın fosilleşmesini durdurur. Antik oral mikrobiyomların çoğu fosilleşmiş plaktan elde edilirken, bu çalışma doğrudan dişi hedef aldı.

S. mutans’ın antik çağ ağızlarında az bulunmasının bir başka nedeni de 
bu şekeri seven tür için uygun yaşam alanlarının bulunmaması olabilir. Binlerce yıl önce tahıl tarımının benimsenmesinden sonra arkeolojik kayıtlarda diş çürüklerinde bir artış görülüyor, ancak çok daha dramatik bir artış ancak şekerli yiyeceklerin kitlelere tanıtıldığı son birkaç yüz yılda meydana geldi.
Örneklenen dişler, University College Cork’tan merhum Peter Woodman tarafından County Limerick’teki Killuragh Mağarası’nda kazılan daha büyük bir iskelet topluluğunun parçasıydı. Mağaradaki diğer dişlerde ileri düzeyde diş çürüğü görülürken, örnek alınan dişlerde herhangi bir çürük görülmedi. Ancak bir diş, benzeri görülmemiş miktarda 
S. mutans DNA’sı üretti; bu, oral mikrobiyal topluluktaki aşırı dengesizliğin bir işaretidir.
Trinity Genetik ve Mikrobiyoloji Okulu’nda yardımcı doçent ve çalışmanın kıdemli yazarı Dr. Lara Cassidy, “Bu 4.000 yıllık dişte bu kadar çok miktarda 
S. mutans görmek bizi çok şaşırttı ” dedi. 
“Bu son derece nadir bir bulgu ve bu adamın ölümünden hemen önce çürük geliştirme riskinin yüksek olduğunu gösteriyor.”

Devamını oku: Bilim insanları, yüzyıllar boyunca değişen insan beslenmesinin etkisini aydınlatmak için 4.000 yıllık dişlerden genetik sırlar çıkarıyor

https://www.sciencedaily.com/releases/2024/03/240327124735.htm

Anılar, DNA’yı kırarak ve düzelterek yapılır

Sinir hücreleri, enflamatuar bir yanıt yardımıyla uzun süreli anılar oluşturur, farelerde yapılan çalışmalar sonucu bulunuyor.

Nöronlar (burada renkli bir taramalı elektron mikrografında gösterilmiştir) hafıza oluşumu sırasında kırık DNA’yı onarır.

Uzun süreli bir hafıza oluştuğunda, bazı beyin hücreleri, DNA’larını kıracak kadar güçlü bir elektriksel aktivite yaşarlar. Daha sonra, enflamatuar bir yanıt devreye girer, bu hasarı onarır ve hafızayı güçlendirmeye yardımcı olur, farelerde yapılan bir çalışma gösterir.
Bulgular, 27 Mart’ta Nature’da yayınlandı
1Cambridge’deki Massachusetts Institute of Technology’de nörobiyolog olan ve çalışmaya dahil olmayan Li-Huei Tsai, “son derece heyecan verici” diyor. Anı oluşturmanın “riskli bir iş” olduğu resmine katkıda bulunduklarını söylüyor. Normalde, çift sarmal DNA molekülünün her iki zincirindeki kırılmalar, kanser de dahil olmak üzere hastalıklarla ilişkilidir. Ancak bu durumda, DNA hasar ve onarım döngüsü, anıların nasıl oluşabileceği ve sürebileceği konusunda bir açıklama sunar.
Aynı zamanda kışkırtıcı bir olasılık ortaya koyuyor: Bu döngü, Alzheimer gibi nörodejeneratif hastalıkları olan kişilerde hatalı olabilir ve bir nöronun DNA’sında hataların birikmesine neden olabilir, diyor Albert Einstein Tıp Fakültesi’nde bir sinirbilimci olan ortak yazar Jelena Radulovic New York’ta.

Devamını oku: Anılar, DNA’yı kırarak ve düzelterek yapılır

https://www.nature.com/articles/d41586-024-00930-y

Antropologlar ‘ırk bilimine’ karşı silahlanıyor

Biyolojik antropologlar, yıllık toplantılarında, ırkçı araştırmaların kötüye kullanılmasını engellemek için bir oyun kitabı oluşturmaya başladılar.

Antropologlar, insanların birkaç ayrı ırka bölündüğü şeklindeki yanlış düşünceyle savaşıyorlar. İnsan genlerinin ve popülasyonlarının karmaşık varyasyon ve karışım kalıpları gösterdiğini vurguluyorlar.

LOS ANGELES—Birine Neandertal demek bir zamanlar hakaretti, yani onu parmak eklemi sürükleyen bir vahşi olarak görüyordunuz. “[Neandertaller] her zaman kendimiz hakkında düşünmek için bir ayna olarak kullanılmıştır … Colorado Boulder Üniversitesi’nde popülasyon genetikçisi olan Fernando Villanea, geçen hafta Amerikan Biyolojik Antropologlar Birliği’nin (AABA) yıllık toplantısında, kendimizle ilgili sevmediğimiz şeyleri başka bir insan grubuna yansıtmak” dedi.
Bilim adamları, Neandertallerin kültürel gelişmişliği ve yetenekleri hakkında daha fazla şey öğrendikçe, kamuoyundaki imajları parladı. Bazı insanlar için, 2007’de bazı Neandertallerin kızıl saçlı ve açık tenli olduklarını gösteren genler taşıdıklarına dair geniş çapta duyurulan keşifle statüleri daha da yükseldi. Avrupa ve Asya’nın bu eski sakinleri beyaz olarak kodlandı ve sosyal medyada bazı insanlar Neandertal atalarının ırksal üstünlüğün bir işareti olduğunu iddia etmeye başladı.

Bilimin bu şekilde kötüye kullanılması, araştırmacıları ırk bilimiyle mücadeleye adanmış bir AABA sempozyumu düzenlemeye ya da genlerin ve diğer biyolojik varyasyonların insanları ırklara ayırmak için kullanılabileceği fikrini – bazıları diğerlerinden üstün – düzenlemeye teşvik etti.
Devamını oku: Antropologlar ‘ırk bilimine’ karşı silahlanıyor

https://www.science.org/content/article/anthropologists-take-arms-against-race-science

Çip üzerinde kalp modelleri COVID iltihabı

İmmün kaynaklı disfonksiyonun kardiyak doku modeli, serbest mitokondriyal DNA’nın rolünü ve eksozomların terapötik etkilerini ortaya koymaktadır.

Çip üzerinde olgun kalp modellerinin geliştirilmesindeki muazzam ilerlemeye rağmen, insan hücresi tabanlı miyokard iltihabı modelleri eksiktir. Burada, şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs 2 (SARS-CoV-2) kaynaklı akut miyokarditi modellemek için dolaşımdaki bağışıklık hücrelerine sahip vaskülarize bir çip üzerinde kalp biyomühendisliği yaptık. Bağışıklık hücrelerinin varlığı proinflamatuar sitokinlerin salgılanmasını artırdığı, kasılma fonksiyonunun ilerleyici bozulmasını tetiklediği ve hücre içi kalsiyum geçişlerini değiştirdiği için koronavirüs hastalığının (COVID-19) kaynaklı miyokard iltihabının ayırt edici özelliklerini gözlemledik. Dolaşımdaki hücresiz mitokondriyal DNA’nın (ccf-mtDNA) yükselmesi ilk olarak çip üzerinde kalpte ölçüldü ve daha sonra düşük sol ventrikül ejeksiyon fraksiyonu olan COVID-19 hastalarında doğrulandı, bu da mitokondriyal hasarın inflamasyona bağlı kardiyak disfonksiyonun önemli bir patofizyolojik ayırt edici özelliği olduğunu gösterdi. Bu platformu SARS-CoV-2 kaynaklı miyokard iltihabı bağlamında kullanarak, endotel hücresinden türetilmiş eksozomların uygulanmasının kasılma açığını etkili bir şekilde kurtardığını, kalsiyum kullanımını normalleştirdiğini, kasılma kuvvetini yükselttiğini ve ccf-mtDNA’yı azalttığını ve Toll benzeri reseptör-nükleer faktör κB sinyal ekseni yoluyla sitokin salınımını azalttığını belirledik.

https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adk0164

Devamını oku: Çip üzerinde kalp modelleri COVID iltihabı

Çocuk felci hâlâ burada!

Çocuk felci aşıları 1950’lerden beri mevcut ancak Afganistan ve Pakistan’ın uzak bölgelerinde aşılamanın getirdiği zorluklar, çocuk felcinin dünya çapında ortadan kaldırılmasını engelledi. 2022’de ABD’nin New York Eyaleti’nin bazı bölgelerinde çocuk felcinin dolaşımda olduğu tespit edildi. Çocuk felci virüsü, ikiye kesilmiş şekilde gösterilen, çeşitli proteinlerden oluşan bir ikosahedral kapsid içine alınmış küçük bir RNA genomuna sahiptir.

https://proteopedia.org/wiki/index.php/FirstGlance/Virus_Capsids_and_Other_Large_Assemblies#Polio_Virus

Bilim adamları altı bacaklı bir fare embriyosu yaptılar – işte nedeni

Üreme organları yerine iki ekstra uzvu olan bir kemirgen, bir gen yolunun ilkel bir yapının kaderini belirlemedeki hayati rolünü gösteriyor.

Tipik bir fare embriyosunun (solda) dört uzvu vardır. Belirli bir genin gelişiminin yarısında kapatıldığı bir embriyonun altı uzvu vardır ve iç organlarının birçoğu karnından dışarı çıkar.

Bu altı bacaklı hayvan bir böcek değil; üreme organlarının olması gereken yerde fazladan iki uzuv bulunan bir fare. 20 Mart’ta 
Nature Communications 1’de
 yayınlanan, genetiği değiştirilmiş bu kemirgen üzerinde yapılan araştırma, DNA’nın 3 boyutlu yapısındaki değişikliklerin 
embriyoların gelişimini nasıl etkileyebileceğini 
ortaya çıkardı 
.
Portekiz’in Oeiras kentindeki Gulbenkian Bilim Enstitüsü’nden gelişim biyoloğu Moisés Mallo ve meslektaşları, embriyonik gelişimin birçok yönünde rol oynayan bir sinyal yolundaki reseptör proteinlerinden biri olan Tgfbr1 üzerinde çalışıyorlardı. Bilim insanları, değişikliğin 
omurilik gelişimini nasıl etkilediğini görmek için fare embriyolarındaki 
Tgfbr1 genini gelişimin yaklaşık yarısında etkisiz hale getirdi .

Devamını oku: Bilim adamları altı bacaklı bir fare embriyosu yaptılar – işte nedeni

https://www.nature.com/articles/d41586-024-00943-7