Nadir görülen genetik bozukluk ilk kez rahimde tedavi edildi

Şu anda neredeyse üç yaşında olan çocukta, sıklıkla ölümcül olan motor nöron hastalığının hiçbir belirtisi görülmüyor.

İki buçuk yaşındaki bir kız, rahimdeyken motor nöron rahatsızlığı için tedavi gören ilk kişi olduktan sonra nadir görülen bir genetik bozukluğun hiçbir belirtisini göstermiyor. Çocuğun annesi, hamileliğin sonlarında gen hedefli ilacı aldı ve çocuk da almaya devam ediyor.

Avustralya’daki UNSW Sydney’de pediatrik nörolog olan Michelle Farrar, “Bebek etkili bir şekilde tedavi edildi ve hastalığın hiçbir belirtisi görülmedi” diyor. Sonuçlar dün New England Journal of Medicine’de yayımlandı.

Çocuk, hareketi kontrol eden motor nöronları etkileyen ve ilerleyici kas zayıflamasına yol açan spinal musküler atrofi olarak bilinen genetik bir rahatsızlıkla gebe kaldı. Yaklaşık her 10.000 doğumdan birinde bu rahatsızlığın bir türü görülür — bu da onu bebeklerde ve çocuklarda önde gelen genetik ölüm nedeni yapar.

En şiddetli formunda, bu çocukta olduğu gibi, bireyler SMN1 geninin her iki kopyasından da yoksundur ve bu eksikliği kısmen telafi eden komşu bir gen olan SMN2’nin yalnızca bir veya iki kopyasına sahiptir . Sonuç olarak, vücut omurilik ve beyin sapındaki motor nöronlarını korumak için gereken proteini yeterince üretmez. Bu protein, ikinci ve üçüncü trimesterlerde ve yaşamın ilk birkaç ayında en önemlidir. Şiddetli hastalığı olan bebekler genellikle üçüncü yaş günlerinden sonra yaşamazlar.

Geçtiğimiz on yılda, ABD Gıda ve İlaç Dairesi (FDA) spinal musküler atrofi için yenidoğanları tedavi etmek üzere üç ilacı onayladı. Bu çalışmada kullanılan Risdiplam adlı oral ilaç, İsviçre’nin Basel kentinde bulunan biyoteknoloji firması Roche tarafından üretilen, SMN2 geninin ifadesini değiştirerek daha fazla SMN proteini üreten küçük bir moleküldür.

Şimdiye kadar spinal musküler atrofi için tedaviler doğumdan sonra uygulanıyordu. Ancak SMN1 geninin her iki kopyasından da yoksun ve SMN2 geninin yalnızca iki kopyasına sahip yenidoğanların yarısına kadarı bazı semptomlarla doğuyor. Çalışmaya liderlik eden, Tennessee, Memphis’teki St. Jude Çocuk Araştırma Hastanesi’nde klinik sinir bilimci olan Richard Finkel, “Hala iyileştirme için yer vardı” diyor.

Ebeveyn önerisi

Finkel, ilacın rahimde verilmesi fikrinin ebeveynlerden geldiğini söylüyor. “Bu korkunç hastalıktan dolayı zaten bir kayıp yaşamışlardı,” diyor ve doğumdan önce başlayabilecekleri tedavi seçenekleri olup olmadığını bilmek istiyorlardı. FDA bu birey için çalışmayı onayladı.

32 haftalık hamile olan anne, altı hafta boyunca her gün Risdiplam aldı. Bebek ilacı yaklaşık bir haftalıkken almaya başladı ve muhtemelen hayatının geri kalanında almaya devam edecek.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsiniz.

Yapay zeka, DNA’da depolanan dijital verileri günler yerine dakikalar içinde çözebilir

Yeni bir yapay zeka tabanlı yöntem, DNA dizilerinden dijital verileri eski tekniklere göre yaklaşık 90 kat daha hızlı bir şekilde kurtarabilir ve bu da hesaplama için pratik DNA depolama olasılığını artırır.

Yapay zeka, DNA zincirlerinde saklanan verileri, önceki yöntemlerde günlerce süren okuma sürelerinden ziyade 10 dakika gibi bir sürede okuyabiliyor. Bu da DNA depolamayı, bilgisayarlarda pratik kullanıma daha da yakınlaştırıyor.

Kaliforniya Üniversitesi, San Diego’dan Daniella Bar-Lev, “DNA, büyük miktarda veriyi son derece kompakt bir biçimde depolayabilir ve binlerce yıl boyunca bozulmadan kalabilir” diyor. “Ek olarak, DNA doğal olarak çoğaltılabilir ve bu da uzun vadeli veri saklama için benzersiz bir avantaj sunar.”

Ancak DNA’da kodlanmış bilgileri geri almak devasa bir zorluktur çünkü depolandığında iplikler birbirine karışır ve iç içe geçer. Veri kodlama süreci sırasında, bazen bireysel iplikler kusurlu bir şekilde çoğaltılır ve bazı parçalar tamamen kaybolabilir. Sonuç olarak, DNA’da depolanan verileri okumak, parçalanmış, yazım hatalarıyla dolu sayfalarla dolu bir kutudan bir kitabı yeniden inşa etmeye benzeyebilir.

Bar-Lev, “Geleneksel yöntemler bu kaosla mücadele ediyor ve günlerce işlem gerektiriyor,” diyor. Yeni yaklaşım, “gürültüdeki kalıpları tespit etmek üzere eğitilmiş AI ile bunu kolaylaştırıyor” diyor.

Bar-Lev ve meslektaşları, karışık DNA dizilerini hızlı ve doğru bir şekilde çözebilen DNAformer adlı yapay zeka destekli bir yöntem geliştirdiler. Sistem, DNA dizilerini yeniden oluşturmak üzere eğitilmiş derin öğrenme yapay zeka modeli, hataları tespit edip düzelten ayrı bir bilgisayar algoritması ve kalan hataları düzeltirken her şeyi tekrar dijital veriye dönüştüren üçüncü bir kod çözme algoritması içeriyor.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsiniz.

Araştırmacılar sinerjik ilaç kombinasyonlarını belirlemek için yeni bir hesaplamalı yaklaşım geliştirdiler

Yeni yöntem, etkili ilaç eşleştirmelerini doğru bir şekilde tahmin ederek yeni terapötiklerin daha hızlı geliştirilmesi için temel oluşturuyor

Mount Sinai’deki Icahn Tıp Fakültesi’ndeki araştırmacılar, ilaç sinerjisinin tahminini iyileştirmek ve karmaşık hastalıklar için kombinasyon terapilerinin geliştirilmesini hızlandırmak için iDOMO adlı güçlü bir hesaplama aracı geliştirdiler.  
Briefings in Bioinformatics’te  20 Şubat’ta yayınlanan çalışma, iDOMO’nun gen ifadesi verilerini kullanarak sinerjik ilaç kombinasyonlarını belirleme yeteneğini vurgulayarak mevcut yöntemlerden daha iyi performans gösteriyor.

Hesaplamalı Yaklaşımlarla İlaç Keşfini İlerletme

Hastalıkta yer alan farklı yolları hedeflemek için birden fazla ilaç kullanan kombinasyon terapileri, kanser gibi karmaşık durumları tedavi etmek için giderek daha kritik hale geliyor. Ancak, etkili ilaç çiftlerini deneysel olarak belirleme süreci maliyetli ve zaman alıcıdır. iDOMO, belirli bir biyolojik örnekteki genlerin aktivite seviyelerini ölçen gen ifadesi verilerini ve hastalık durumu veya ilaç tepkisi gibi belirli bir durumla ilişkili farklı gen aktivitesi kalıpları olan gen imzalarını analiz ederek hesaplamalı bir çözüm sunar. İlaçların ve hastalıkların gen imzalarını karşılaştırarak iDOMO, ilaç kombinasyonlarının faydalı ve zararlı etkilerini tahmin eder.

“Yaklaşımımız, insan hastalıklarını tedavi etmek için yeni tedavi seçenekleri olarak hizmet edebilecek ilaç kombinasyonlarını tahmin etmek için daha etkili bir yol sunuyor,” diyor kıdemli yazar Bin Zhang, PhD, Nörogenetik Willard TC Johnson Araştırma Profesörü ve Mount Sinai Dönüşümsel Hastalık Modelleme Merkezi Müdürü. “Bu, klinisyenler için tedavi seçeneklerini önemli ölçüde genişletebilir ve standart tedavilere yanıt vermeyen hastalar için sonuçları iyileştirebilir.”

Üçlü Negatif Meme Kanserinde Doğrulama

Çalışma, iDOMO’yu özellikle agresif ve tedavisi zor bir kanser türü olan üçlü negatif meme kanserine uyguladı. Model, daha sonra  in vitro  deneylerde test edilen umut verici bir ilaç kombinasyonunu (trifluridin ve monobenzon) belirledi. Bulgular, bu kombinasyonun üçlü negatif meme kanseri hücre büyümesini tek başına her iki ilaçtan daha etkili bir şekilde engellediğini doğrulayarak iDOMO’nun öngörüsünü doğruladı.

Dr. Zhang, “iDOMO gibi hesaplamalı yaklaşımlardan yararlanarak, daha ileri deneysel doğrulama için en umut verici ilaç kombinasyonlarına öncelik verebilir ve bu sayede çok çeşitli hastalıklar için yeni tedavilerin keşfini hızlandırabiliriz” diye ekledi.

Tıp ve Araştırma İçin Sonuçlar ve Gelecekteki Yönlendirmeler

iDOMO, klinisyenlere daha fazla terapötik seçenek sunarak, potansiyel olarak konvansiyonel tedavilere dirençli hastalar için yeni ve daha etkili tedavilere yol açar. Yaklaşım, sinerjik ilaç çiftlerini belirlemek için maliyet açısından verimli, ölçeklenebilir bir çözüm sunarak çeşitli hastalıklarda daha geniş uygulamalara giden yolu açar.

Gelecekteki çalışmalar, iDOMO’nun üçlü negatif meme kanserinin ötesinde diğer hastalıklara da uygulanmasına, öngörü yeteneklerinin daha da geliştirilmesine ve daha geniş ilaç geliştirme hatlarına entegre edilmesine odaklanacak.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsiniz.

Umut vadeden yeni bir sıtma önleyici ilaç sınıfı keşfedildi

Epigenetik inhibitörler umut vadeden yeni bir sıtma karşıtı müdahale stratejisi olarak mı? Yeni bir çalışma, sıtma patojenini özel olarak öldüren bir gen düzenleme inhibitörünü tanımlıyor.

Profesör Markus Meißner (LMU Münih) ve Profesör Gernot Längst (Regensburg Üniversitesi) liderliğindeki çok uluslu bir araştırma ekibi, 
sıtmanın ana nedeni olan 
Plasmodium falciparum’un gen düzenlenmesi konusunda önemli bilgiler elde etti.

Nature dergisinde yayımlanan bulgular, yenilikçi tedavi yaklaşımlarının geliştirilmesi için yeni fırsatlar sunuyor.

Sıtma, küresel sağlık açısından en büyük tehditlerden biri olmaya devam ediyor. 2022’de, çoğunluğu Sahra Altı Afrika’da olmak üzere tahmini 247 milyon enfeksiyon ve 600.000’den fazla ölüm yaşandı.

Bu nedenle önleme ve tedavide uzun vadeli ilerleme sağlamak için yenilikçi araştırma yaklaşımlarına acilen ihtiyaç duyulmaktadır.

Sıtma, Plasmodium cinsi parazitlerin neden olduğu ve enfekte sivrisineklerin ısırmasıyla insanlara bulaşan bir hastalıktır.

Sıtma türlerinin en ölümcülü olan Plasmodium falciparum’un , hassas gen düzenlemesiyle kontrol edilen oldukça karmaşık bir yaşam döngüsü vardır.

Bu düzenleyici süreçleri anlamak, patojenle gelişimin farklı aşamalarında özel olarak mücadele edebilmek için hayati önem taşımaktadır.

Ekip, kromatin yeniden düzenleyicisi PfSnf2L’yi (transkripsiyon için DNA’nın erişilebilirliğini düzenleyen bir protein kompleksi) patojenin gelişiminin çeşitli aşamalarında önemli rol oynayan genlerin temel düzenleyicisi olarak tanımladı.

Çalışmanın baş yazarı Maria Theresia Watzlowik, “Araştırmamız, PfSnf2L’nin P. falciparum’un gen ifadesini dinamik olarak ayarlaması için gerekli olduğunu gösteriyor” şeklinde açıklıyor.

“PfSnf2L’nin benzersiz dizisi ve işlevsel özellikleri, yalnızca Plasmodium falciparum’u öldüren son derece spesifik bir inhibitörün tanımlanmasına yol açtı ,” diye açıklıyor Regensburg Üniversitesi’nde Biyokimya Profesörü olan Gernot Längst.

LMU Veterinerlik Fakültesi Deneysel Parazitoloji Kürsü Başkanı Profesör Markus Meißner, “Bu inhibitör, potansiyel olarak tüm yaşam döngüsü aşamalarını hedef alan yeni bir sıtma önleyici ilaç sınıfını temsil ediyor” diye ekliyor.

Längst, “Sıtma, karşı karşıya kaldığımız en adaptif hastalıklardan biridir” diyor.

Epigenetik düzenlemesini hedeflemek, örneğin mevcut ilaçların etkinliğini artırmanın veya dirençli parazitlerin gelişmesini önlemenin önünü açabilir.

“Çalışma, epigenetiğin sıtma araştırmalarına entegre edilmesinin önemini vurguluyor. Gelecekteki çalışmalar, parazitin epigenetik mekanizmasını engelleyen küçük molekülleri test etmeye ve klinik öncesi modellerde bunların etkinliğini keşfetmeye odaklanacak,” diye sonlandırıyor Meißner.

Alman Araştırma Vakfı’nın (DFG) desteklediği çalışmada, LMU ve Regensburg Üniversitesi’nden bilim insanlarının yanı sıra, Zürih Üniversitesi (İsviçre), Pennsylvania Eyalet Üniversitesi (ABD) ve Glasgow Üniversitesi’nden (İngiltere) araştırmacılar da yer aldı.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsiniz.

Vücudumuzun Hangi Parçalarına İhtiyacımız Yok?

Evrim bize artık ihtiyacımız olmayan bazı organ ve işlevler bıraktı.

Vücutlarımız birer evrim müzesi gibi. İki ayak üzerinde yürüyoruz çünkü ortak atalarımızdan biri, milyonlarca yıl önce bunu yapmak üzere evrimleşmişti. Ayrıca bir sergi salonu gibi esas amaçlarından daha uzun yaşayan organ ve işlevler barındırıyoruz.

Örneğin apandisi ele alalım. Eskiden bitki yönünden baskın bir beslenme şeklinde önem taşıyan bu organ, beslenme değişiklikleri sebebiyle artık gerekli olmadığını düşünen (fakat yanılan) evrim bilimci Charles Darwin tarafından azledilmişti. Yirmilik dişler eski insanların çiğ kökler ve sert etleri kemirmesine yardımcı olmuştu ancak besinlerimiz artık daha fazla işlendiği için bugün pahalı bir diş komplikasyonundan fazlası değiller. Önceden sıcaklık ve yırtıcılara karşı koruma amacıyla vücut kıllarını kabartmanın kullanışlı bir yolu olan kıl dikelmesi bile artık kısa süreli estetik bir dram anından fazlası olarak görülmüyor.

Peki bu vücut parça ve işlevleri neden hâlâ çoğumuzda var?

Johns Hopkins Üniversitesi Tıp Fakültesinin Fonksiyonel Anatomi ve Evrim Merkezi direktörü Matthew Ravosa, sebebinin bize herhangi bir zarar vermemeleri olabileceğini söylüyor. Bir avantaj sunmayabilseler bile dezavantajın olmayışı, genelde popülasyondaki özellikleri ortadan kaldıran doğal seçilim baskılarını azaltıyor.

Bu özelliklerin bazıları ise çevre, davranış veya seçilim baskılarındaki evrimsel değişimler sebebiyle kalmış ya da amacı değişmiş. “Apandis bunun güzel bir örneği” diyor Ravosa.

Önceden işlevini kaybettiği düşünülen apandis, bağışıklık sisteminin patojenlerle savaşmasına yardım ederek bağırsak sağlığında önemli bir rol oynuyor olabilir. Yüksek bir yoğunlukta bağışıklık dokusu içeriyor ve bir hastalık ya da antibiyotik kullanımından sonra bağırsak mikrobiyomuna yeniden yerleşen faydalı bakterileri barındırıyor. Bu durumun anlaşılması, apandisin gereksiz bir organ olduğuna yönelik uzun zamandır süregelen bir inanışa meydan okumuştu.

Stanford Üniversitesindeki Snyder Laboratuvarı’nın başındaki isim Michael Snyder, “İhtiyaç fazlalığı bazen belli koşullar altında kendini gösterir; bazı şeyler aslında lüzumsuz değildir” diyor. “Apandise geri dönersek, bir yararının olduğu öne sürülüyor.”

Neyin gerçekten gereksiz olduğu ve vücudun hangi parçalarının farklı bir şekilde de olsa hâlâ işlev gösterdiği çok iyi anlaşılmış değil. Yine de insanların, amaçsız olduğu anlaşılan bazı vücut parçalarıyla doğduğunu görmeye başlıyoruz. Yapılan çalışmalar, popülasyonun yüzde 35 kadarının artık yirmilik dişleri olmadan doğduğunu gösteriyor. (Şanslılar!) Kolun ön tarafında yer alan, bazı kişilerde bulunan ve diğerlerinde olmayan palmaris longus kirişi, bir zamanlar tırmanma ve tutma faaliyetlerine yardımcı olsa da artık alakasız bir işlevi var. Araştırmalar, popülasyonun ufak bir yüzdesinin bu kiriş olmadan doğduğunu gösteriyor; üstelik bu kasın olmaması, kavrama kuvvetini önemli şekilde etkilemiyor.

Evrim devam ettiğinden; beslenme şekillerimiz, tıbbi müdahaleler ve teknolojik ilerleme sebebiyle daha fazla parça atmanın eşiğinde olabilir miyiz?

Geleceğe dönük bilimsel sorularda sık sık olduğu gibi cevap, gerçekte kimsenin bilmediği yönünde.

Ravosa şöyle açıklıyor: “Geleceğin bizim için ne taşıdığı hakkında herhangi bir fikrimiz olduğunu gösteren hiçbir şey yok çünkü teknolojinin hızı değişiyor ve bu durum evrimi çok büyük bir şekilde etkiliyor olabilir. Ayrıca tahmin etmek düşündüğümüzden çok daha zor.”

“İşlevini yitiren organlarla ilgili bir şey öğrenirken çoğunlukla geçmişe bakıyoruz” diye ekliyor bilim insanı. “Bekleyip görmek zorundayız çünkü geleceği tahmin edemiyoruz.”

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsiniz.

Yazdırılabilir molekül seçici nanopartiküller, giyilebilir biyosensörlerin seri üretimini mümkün kılıyor.

Tıbbın geleceği, sağlık hizmetlerinin kişiselleştirilmesinde yatıyor olabilir – bir bireyin tam olarak neye ihtiyacı olduğunu bilmek ve daha sonra durumlarını stabilize etmek ve iyileştirmek için gerekirse doğru besin, metabolit ve ilaç karışımını sunmak. Bunu mümkün kılmak için, doktorların öncelikle sağlığın belirli biyobelirteçlerini sürekli olarak ölçmek ve izlemek için bir yola ihtiyaçları vardır.

Bu amaçla, Caltech mühendislerinden oluşan bir ekip, uzun ömürlü giyilebilir ter sensörlerinin seri üretimini sağlayan özel nanopartiküllerin mürekkep püskürtmeli baskı dizileri için bir teknik geliştirdi. Bu sensörler, vitaminler, hormonlar, metabolitler ve ilaçlar gibi çeşitli biyobelirteçleri gerçek zamanlı olarak izlemek için kullanılabilir ve hastalara ve doktorlarına bu moleküllerin seviyelerindeki değişiklikleri sürekli olarak takip etme yeteneği sağlar.

Yeni nanopartikülleri içeren giyilebilir biyosensörler, uzun süreli COVID’den muzdarip hastalarda metabolitleri ve Duarte, California’daki City of Hope’daki kanser hastalarında kemoterapi ilaçlarının seviyelerini izlemek için başarıyla kullanıldı.

Caltech’teki Andrew ve Peggy Cherng Tıp Mühendisliği Bölümü’nde tıp mühendisliği profesörü olan Wei Gao, “Bunlar neyin mümkün olduğuna dair sadece iki örnek” diyor. “Bu sensörlerin artık bize sürekli ve noninvaziv bir şekilde izleme imkanı verdiği birçok kronik durum ve bunların biyobelirteçleri var” diyor Nature Materials dergisinde yeni tekniği açıklayan bir makalenin ilgili yazarı olan Gao.

Gao ve ekibi, nanoparçacıkları çekirdek kabuklu kübik nanoparçacıklar olarak tanımlıyor. Küpler, araştırmacıların izlemek istediği molekülü (örneğin, C vitamini) içeren bir çözelti içinde oluşturulmuştur. Monomerler kendiliğinden bir polimer oluşturmak için bir araya geldikçe, hedef molekül – C vitamini – kübik nanopartiküllerin içinde sıkışıp kalır. Daha sonra, C vitamini moleküllerini spesifik olarak çıkarmak için bir çözücü kullanılır ve arkasında, C vitamini moleküllerininkiyle tam olarak eşleşen şekillere sahip deliklerle noktalı moleküler olarak basılmış bir polimer kabuk bırakılır – sadece belirli moleküllerin şekillerini seçici olarak tanıyan yapay antikorlara benzer.

Daha da önemlisi, yeni çalışmada, araştırmacılar bu özel olarak oluşturulmuş polimerleri nikel hekzasiyanoferrattan (NiHCF) yapılmış bir nanopartikül çekirdek ile birleştiriyorlar. Bu malzeme, insan teri veya diğer vücut sıvıları ile temas ettiğinde uygulanan bir elektrik voltajı altında oksitlenebilir veya indirgenebilir. C vitamini örneğine dönersek, C vitamini şeklindeki delikler boş olduğu sürece sıvı NiHCF çekirdeği ile temas edecek ve bu bir elektrik sinyali üretecektir.

Bununla birlikte, C vitamini molekülleri polimer ile temas ettiğinde, bu deliklere kayarlar, böylece ter veya diğer vücut sıvılarının çekirdekle temas etmesini önlerler. Bu, elektrik sinyalini zayıflatır. Elektrik sinyalinin gücü, o zaman, ne kadar C vitamini bulunduğunu ortaya çıkarır.

“Bu çekirdek kritiktir. Nikel hekzasiyanoferrat çekirdeği, biyolojik sıvılarda bile oldukça kararlıdır ve bu sensörleri uzun süreli ölçüm için ideal hale getirir “diyor aynı zamanda Heritage Medical Research Institute Araştırmacısı ve Ronald ve JoAnne Willens Scholar olan Gao.

Yeni çekirdek-kabuk nanopartikülleri çok yönlüdür ve tek bir dizide birden fazla nanopartikül “mürekkep” kullanarak ter veya vücut sıvılarındaki çoklu amino asitlerin, metabolitlerin, hormonların veya ilaçların seviyelerini ölçen sensör dizilerinin yazdırılmasında kullanılır. Örneğin, makalede açıklanan çalışmada, araştırmacılar, böbreklerin ne kadar iyi çalıştığını görmek için yaygın olarak ölçülen bir biyobelirteç olan amino asit triptofan ve kreatinin’e bağlanan diğer nanopartiküllerle birlikte C vitaminine bağlanan nanopartikülleri bastılar. Tüm nanopartiküller, daha sonra seri üretilen tek bir sensörde birleştirildi. Bu üç molekül, uzun süreli COVID’li hastaların çalışmalarında ilgi çekicidir.

Benzer şekilde, araştırmacılar, daha sonra City of Hope’daki kanser hastaları üzerinde test edilen bireysel sensörler üzerinde üç farklı antitümör ilaca özgü nanopartikül bazlı giyilebilir sensörler bastılar.

Gao, “Bu teknolojinin potansiyelini göstererek, herhangi bir zamanda vücuttaki kanser ilaçlarının miktarını uzaktan izleyebildik” diyor. “Bu, sadece kanser için değil, diğer birçok koşul için de doz kişiselleştirme hedefine giden yolu işaret ediyor.”

Makalede, ekip ayrıca nanopartiküllerin, vücuttaki ilaç seviyelerini hassas bir şekilde izlemek için cildin hemen altına implante edilebilecek sensörleri basmak için kullanılabileceğini gösterdi.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Farelerde kalp krizi için gen tedavisi daha da kesin hale geldi.

Eğer insanlar, kertenkelelerin ve balıkların rutin olarak yaptığı gibi hasar görmüş dokuları yeniden büyütebileceklerse, gen ekspresyonunun zaman ve mekanda hassas bir şekilde kontrol edilmesini gerektirecektir – aksi takdirde, her yerde büyüyen rastgele hücreler veya büyümeyi asla bırakmayan yeni bir vücut parçası ile sonuçlanabilir. Yani, süreci durdurmak da en az başlatmak kadar önemlidir.

Diğer hayvanların hasarlı dokuları nasıl yeniden büyüttüğünü inceleyen Duke bilim adamlarından oluşan bir ekip, rejeneratif makinenin en az bir parçasını bu tür bir hassasiyetle kontrol etmek için önemli bir adım attı. Zebra balıklarının kalplerindeki hasarı onarmak için güvendikleri mekanizmaları, insanlarda gen terapisi için kullanılan viral vektörlerle birlikte kullandılar.

13 Aralık’ta Cell Stem Cell’de çevrimiçi olarak yayınlanan yeni bir makalede, araştırmacılar, tüm organda sürekli olarak aktif olmak yerine, yaralanmaya yanıt olarak gen aktivitesini kontrol etme, onu belirli bir doku bölgesiyle sınırlama ve belirli bir zaman penceresi boyunca kontrol etme yeteneğini gösteriyorlar.

Doku yenilenme arttırıcı element olan TREE adını verdikleri bir balık DNA’sı segmentini ödünç aldılar. TREE’ler, bir yaralanmayı algılamaktan ve belirli bir yerde yeniden yapılanma için onarımla ilgili genlerin aktivitesini düzenlemekten sorumlu olan, genomda yer alan bir gen arttırıcılar ailesidir. Bu arttırıcılar ayrıca iyileşme tamamlandıkça gen aktivitesini de kapatabilir. Bu düzenleyici elementler zebra balıklarının yanı sıra meyve sinekleri, solucanlar ve farelerde de bulunmuştur.

Duke Tıp Fakültesi’nde James B. Duke Seçkin Rejeneratif Biyoloji Profesörü olan ve yirmi yıl önce zebra balıklarında kalp yenilenmesini keşfeden ve o zamandan beri üzerinde çalışan Ken Poss, “Muhtemelen bizde de var” dedi. “Ama onları zebra balıklarında bulmak ve memelilerde işe yarayıp yaramadığını sormak bizim için daha kolay.”

Yaklaşık 1.000 nükleotid uzunluğundaki bu güçlendirici diziler, gen aktivitesini bağlamak ve değiştirmek için farklı faktörler ve uyaranlar için tanıma bölgeleriyle doludur. Poss, “Bunu nasıl yaptıklarını ve gerçekten neye tepki verdiklerini tam olarak anlamıyoruz” dedi.

Poss, bir hayvandaki farklı hücre tiplerinin de bu arttırıcıların farklı türlerine sahip olduğunu söyledi. “Bazıları birden fazla dokuda yanıt veriyor – burada kullandıklarımız bunlar. Ancak balıklarda yenilenen omurilik veya yüzgeçlerin profilini çıkardığımızda farklı diziler elde ediyoruz.” İnsan genomunda bu tür güçlendiricilerin on binlercesi olabilir, diye ekledi.

Bu 6 yıllık araştırma projesinin ilk adımı olarak, araştırmacılar embriyonik farelerin genomlarına birkaç farklı türde zebra balığı AĞACI dahil ettiler. Gen aktivitesini belirtmek için görünür bir işaretleyici kullanarak, arttırıcıların yaklaşık yarısının, transgenik memelilerde doku hasarını ne zaman ve nerede algıladıklarında amaçlandığı gibi çalıştığını ve doku mavisine döndüğünü buldular.

Daha sonra, gen dizilerini hücrelere sokmak için tanıdık bir gen terapisi aracı olan adeno-ilişkili virüsü kullanarak geliştirici elementleri seçici olarak yetişkin bir fareye dahil edip edemeyeceklerini bilmek istediler. Virüs, tüm dokulara bir güçlendirici içeren DNA’yı tanıttı, ancak umut, TREE’lerin yalnızca bir yaralanmaya yanıt olarak aktif hale gelmesiydi.

Farelerin kalp krizi modellerinde yapılan bir dizi deney, bir TREE içeren virüslerin yaralanmadan bir hafta önce infüze edilebileceğini ve daha sonra güçlendiricinin yaralanma tespit ettiğinde harekete geçeceğini gösterdi. Ancak, kalp krizinden bir veya iki gün sonra hayvana tanıtıldığında da işe yaradığını buldular. Poss, “Test ettiğimiz üç TREE’nin tümü, yaralanmadan bir gün veya bazen daha uzun süre sonra teslim edilirse etkili olabilir – yine de yaralanmaya yönelik ifadeyi hedefleyebilirler” dedi.

“Bir AĞAÇ ve bir gen iletmenin bu yöntemi, moleküler bir kargoyu doğru zamanda doğru yere teslim etmemize izin verecek mi? Farelerde olduğunu bulduk, “dedi Poss.

Ayrıca, daha insan benzeri bir kalp atış hızına sahip çok daha büyük bir kalbe sahip olan domuzlarda viral olarak bir AĞAÇ ve bir floresan işaretleyici gen verdiler. Kalp krizinden önce veya sonra koroner arterler yoluyla domuz kalplerine virüsler aşıladılar ve yine işaretleyici sadece yaralanma bölgesinde parladı.

Daha sonra, bu sistemin hasarı gerçekten onarıp onaramayacağını görmek için, sadece hasarı algılamak ve dokuyu aydınlatan bir geni açmak yerine, kanserde rol oynayan güçlü bir doku büyüme geni olan hiperaktif bir YAP formu verdiler. Kilit soru, hücre bölünmesini çılgına çevirebilen bu “gerçekten güçlü çekicin” yalnızca doğru zamanda ve yerde çalışmaya kementlenip kementlenemeyeceğiydi.

Farelerde kalp krizinden sonra güvenli bir kas büyümesine sahip olup olamayacaklarını görmek için bir AĞAÇ tarafından kontrol edilen mutasyona uğramış bir YAP kullandılar. Poss, “TREE, birkaç hafta boyunca, sadece yaralanma bölgesinde mutasyona uğramış bir YAP’ı açtı ve sonra doğal olarak ifadeyi kapattı” dedi. Tedavi, kas hücrelerinin bölünmeye başlamasına neden oldu ve farenin kalbi birkaç hafta sonra normale yakın bir işleve geri döndü, ancak bazı yara izleri olmadan değil.

Poss, “YAP’ı tam patlamada ifade etmek istemezsiniz, bu aşırı büyüme gibi sorunlara neden olabilir, ancak bulduğumuz şey, onu yönlendirebileceğimizdir” dedi. Poss, “Bütün hayvan gen terapisini alır, ancak YAP kargosu yalnızca kalbi yaraladığınızda ve nerede yaraladığınızda ölçülebilir seviyelerde ifade edilir” dedi. “Bu yöntemleri, genleri belirli bir zaman ve belirli bir alanda kontrol etmek için kullanabileceğimizi düşünüyoruz ve bu da onları kapatmayı içeriyor.”

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Zebra balığı proteini, kalp onarımı için uyuyan genlerin kilidini açıyor.

Hubrecht Enstitüsü’ndeki Bakkers grubundan araştırmacılar, zebra balığından elde edilen bir proteini kullanarak hasarlı fare kalplerini başarıyla onardılar. Hmga1 proteininin zebra balıklarında kalp yenilenmesinde önemli bir rol oynadığını keşfettiler. Farelerde, bu protein, kalp büyümesi gibi yan etkilere neden olmadan uykuda olan onarım genlerini aktive ederek kalbi eski haline getirmeyi başardı. Hollanda Kalp Vakfı ve Hartekind Vakfı tarafından desteklenen bu çalışma, kalp yetmezliğini önlemek için rejeneratif tedavilere doğru önemli bir adımdır. Bulgular 2 Ocak 2025’te Nature Cardiovascular Research’te yayınlandı.

Kalp krizinden sonra, insan kalbi yeniden büyüyemeyen milyonlarca kas hücresini kaybeder. Bu genellikle kalbin kanı etkili bir şekilde pompalamakta zorlandığı kalp yetmezliğine yol açar. İnsanlardan farklı olarak, zebra balığı yeni kalp kası hücreleri yetiştirir: rejeneratif bir kapasiteye sahiptirler. Bir zebra balığı kalbi hasar gördüğünde, 60 gün içinde işlevini tamamen eski haline getirebilir. Çalışmanın lideri Jeroen Bakkers, “Neden bazı türlerin yaralanmadan sonra kalplerini yenileyebildiğini, diğerlerinin ise bunu yapamadığını anlamıyoruz” diye açıklıyor. “Zebra balıklarını inceleyerek ve onları diğer türlerle karşılaştırarak, kalp yenilenme mekanizmalarını ortaya çıkarabiliriz. Bu, sonunda insanlarda kalp yetmezliğini önlemek için tedavilere yol açabilir.”

Hasarı onaran bir protein

Araştırma ekibi, zebra balıklarında kalp onarımını sağlayan bir protein tespit etti. Çalışmanın ilk yazarı Dennis de Bakker, “Zebra balığı kalbini, insan kalbi gibi yenilenemeyen fare kalbiyle karşılaştırdık” diyor. “Kalbin hasarlı ve sağlıklı kısımlarındaki genlerin aktivitesine baktık” diye açıklıyor. “Bulgularımız, Hmga1 proteini için genin zebra balıklarında kalp rejenerasyonu sırasında aktif olduğunu, ancak farelerde olmadığını ortaya koydu. Bu da bize Hmga1’in kalp onarımında önemli bir rol oynadığını gösterdi.” Tipik olarak, Hmga1 proteini, hücrelerin çok büyümesi gerektiğinde embriyonik gelişim sırasında önemlidir. Bununla birlikte, yetişkin hücrelerde, bu protein için gen kapatılır.

‘Barikatları’ temizlemek

Araştırmacılar Hmga1 proteininin nasıl çalıştığını araştırdılar. “Hmga1’in kromatin üzerindeki moleküler ‘engelleri’ ortadan kaldırdığını keşfettik,” diye açıklıyor ilk yazar Mara Bouwman. Kromatin, DNA’yı paketleyen yapıdır. Sıkıca paketlendiğinde, genler aktif değildir. Paketi açıldığında, genler tekrar aktif hale gelebilir. “Hmga1, tabiri caizse, uykuda olan genlerin işe geri dönmesine izin vererek yolu temizliyor” diye ekliyor.

Balıktan memelilere

Proteinin memelilerde benzer şekilde çalışıp çalışmadığını test etmek için, araştırmacılar onu yerel olarak hasarlı fare kalplerine uyguladılar. Bakkers, “Sonuçlar dikkat çekiciydi: Hmga1 proteini, kalp kası hücrelerini bölünmeye ve büyümeye teşvik ederek kalp fonksiyonlarını önemli ölçüde iyileştirdi” diyor. Şaşırtıcı bir şekilde, hücre bölünmesi sadece hasarlı bölgede meydana geldi – tam olarak onarımın gerekli olduğu yerde. “Aşırı büyüme veya genişlemiş bir kalp gibi herhangi bir olumsuz etki yoktu. Ayrıca sağlıklı kalp dokusunda herhangi bir hücre bölünmesi görmedik, “diye vurguluyor Bouwman. “Bu, hasarın kendisinin süreci etkinleştirmek için bir sinyal gönderdiğini gösteriyor.”

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Kalp sağlığına zarar verdiği tespit edilen proteinlerin geri dönüşümünün bozulması.

Yeni bir çalışma, kalpteki gereksiz veya hasarlı proteinleri parçalamada önemli bir rol oynayan bir enzim tanımladı – kalp sağlığını korumak için önemli bir süreç.

Araştırmada araştırmacılar, ‘ubikitin spesifik peptidaz 5’ veya USP5 olarak adlandırılan bir enzimin düşük seviyelerinin, kalp kası hücrelerinde protein birikmesine yol açtığını ve hayvan modellerinde dilate kardiyomiyopati adı verilen bir tür kalp hastalığını tetiklediğini buldular.

Çalışma, Max Planck Kalp ve Akciğer Araştırmaları Enstitüsü (MPI HLR) tarafından yönetildi ve King’s College London BHF Araştırma Mükemmeliyet Merkezi’ndeki Randall Hücre ve Moleküler Biyofizik Merkezi’nden araştırmacıları içeriyordu. Bulgular Science Advances bülteninde yayımlandı.

USP5’in koruyucu güçleri

Kalpteki yeni proteinlerin dengesini korumak ve eski veya hatalı olanları parçalamak kalp sağlığı için önemlidir. Vücut, hasar gördüklerinde veya artık ihtiyaç duyulmadıklarında proteinleri parçalayan özel atık yönetimi fabrikalarına (proteazomlar olarak adlandırılır) sahiptir. Ancak bu süreç yanlış gittiğinde, proteinler birikebilir ve kalbin işlevini bozarak kalp hastalığına yol açabilir.

“Fonksiyonel olmayan protein “junk” (proteinopatiler) birikiminin neden olduğu kalp hastalığı, kalp yetmezliğinin yaygın nedenleridir. Bu hastalıklar için nedensel bir tedavi yoktur. King’s Moleküler Kardiyoloji Profesörü ve çalışmanın ortak yazarı Profesör Mathias Gautel, “Kök nedeni hedeflemek için yeni yolların belirlenmesi – yanlış katlanmış protein “çöp” birikimi – bu koşulların çoğunu hafifletebilir” diyor.

Proteinler parçalanmaya hazır olduklarında, proteazoma taşınabilmeleri için ubikitin adı verilen moleküler bir işaretleyici ile ‘etiketlenirler’. Protein proteazoma girmeden önce, ubikitin etiketi parçalanır ve parçalanır, tekrar kullanılmaya hazır hale gelir. USP5, ubikitin etiketinin geri dönüştürülmesinde çok önemli bir rol oynar ve proteinlerin üretilmesi ve parçalanması arasında bir denge sağlar.

Yeni terapötik yaklaşımlar arayışında, MPI HLR’deki araştırmacılar, fare modellerinde, düşük USP5 seviyelerinin dilate kardiyomiyopatiye neden olduğunu gösterdi – bir veya her iki kalp odasının genişlediği ve kasılma yeteneklerini azalttığı bir durum.

“Genetik manipülasyon kullanarak, yetişkin hayvanların kalp kası hücrelerinde USP5’i spesifik olarak devre dışı bıraktık. USP5 eksik olduğunda, hayvanlar sonuç olarak dilate kardiyomiyopati geliştirdi “diyor MPI HLR’de doktora sonrası araştırmacı ve makalenin ortak yazarı Dr. Silke Kreher.

“Manyetik rezonans görüntüleme (MRI) kullanarak, bu hayvanların kalplerinin önemli ölçüde büyüdüğünü ve pompalama kapasitesinin ciddi şekilde azaldığını gösterdik” diye ekliyor MPI HLR’de doktora araştırmacısı ve makalenin ortak yazarı Yvonne Eibach.

Araştırmacılar, hücre kültürlerinde ve kardiyomiyopatinin fare modellerinde USP5 seviyelerini arttırdıklarında, kalp hücrelerinin protein “çöplüğünden” arındırıldığını gösterdiler. USP5 seviyeleri artmış fareler, kalpleri yüksek tansiyon gibi durumlarda görülen artan basınç stresi altına girdiğinde daha iyi başa çıkabildiler. Bu deneyler, Gautel laboratuvarının kalp hastalığında rol oynayan hatalı proteinleri incelemedeki uzmanlığı üzerine inşa edildi.

Potansiyel bir terapötik hedef

“Çalışmamız, USP5’in gerekli olduğu dilate kardiyomiyopatide ubikitin zincir geri dönüşümünün rolünü ilk kez vurgulamaktadır. Kalp kası hücrelerinde USP5 kaybını inhibe etmenin veya terapötik olarak artan USP5 konsantrasyonunun protein agregasyonunu azaltacağını ve böylece en azından hastalığın ilerlemesini yavaşlatacağını varsayıyoruz “diyor MPI HLR’den Profesör Thomas Braun, çalışmanın kıdemli yazarı.

Araştırmacılar, USP5’in ilaç geliştirme için bir hedef olup olmayacağını belirlemek için kapsamlı daha fazla araştırmaya ihtiyaç olduğunu vurguluyor. Bir sonraki adım olarak, ekipler dilate kardiyomiyopatide USP5 protein kaybına yol açan mekanizmaları araştırmayı planlıyor.

Profesör Gautel, “Hücre ve hayvan modellerinden başlayarak kalp hücrelerindeki USP5 seviyelerini değiştirmek için etkili ve pratik yollar bulunabilirse, çok çeşitli kalp hastalıklarına karşı yeni tedavilerin geliştirilmesinin yolunu açabilir” diye ekliyor.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Antikor Tedavisi Ciddi Hastalıkları Önleyebileceğinden Kuş Gribi Güncellemesi…

Antikor bazlı bağışıklık terapisi, maymunlarda yapılan denemelerin enfeksiyondan kaynaklanan ciddi hastalıkları ve ölümü başarıyla önlemesinin ardından kuş gribine karşı mücadelede önemli bir silah haline gelebilir.

Önleyici tıp, kuş gribi virüsünün nispeten stabil bir bölgesini hedef alarak çalışır, bu da olası yeni varyantların evrimine dayanabileceği anlamına gelir.

Pittsburgh Üniversitesi’nden immünolog profesör Douglas Reed yaptığı açıklamada, “Testimizde antikor güzel bir performans sergiledi” dedi.

“Bu tür bir önleme, enfeksiyon salgınlarını kontrol etmede ve kuş gribi salgınını kontrol altına almada çok yararlı olabilir.”

Kuş gribi şu anda dünya çapında yabani kuşlar arasında yaygındır ve kümes hayvanları ve sığırlarda salgınlara neden olmaktadır. 2024’ten bu yana, Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri (CDC), Amerika Birleşik Devletleri’nde 67 insan kuş gribi vakası ve virüsten bir ölüm bildirdi.

Hastalık, Güney Amerika’daki deniz aslanları ve Avrupa ve Çin’deki vizonlar gibi daha fazla memelide ortaya çıktıkça, uzmanlar virüsün memeliler arasında daha iyi enfekte olmak ve yayılmak için adapte olduğundan korkuyor.

Çalışmalarında, Reed ve meslektaşları, geniş ölçüde nötralize edici antikorları olan “MEDI8852” ile yapılan bir ön tedavinin, maymun deneklerini H5N1 kuş gribi enfeksiyonunu takiben ciddi hastalık ve ölümden koruduğunu gösterdi.

Maymunlar, küçük parçacıklı aerosoller kullanılarak H5N1 kuş gribi ile enfekte edildi, bu da virüsün akciğerin derinliklerine ulaşmasını ve doğal maruziyeti daha iyi taklit etmesini sağladı. Ekip, serum MEDI8852 seviyelerinin, maymunların yaklaşık 8-12 hafta boyunca korunmasını sağlayacak kadar yüksek kaldığını bildirdi.

Keşif, insanlar için benzer önleyici tedavilerin geliştirilmesine kapı açıyor – örneğin, savunmasız popülasyonları ciddi hastalıklardan korumak için kullanılabilecek şekilde.

Reed, Newsweek’e verdiği demeçte, “Antikor, insan grip virüslerine karşı insan klinik denemelerinde zaten test edildi, bu nedenle gelişme oldukça hızlı olabilir” dedi.

“Herkes için yararlı olmaz, ancak ilk müdahale ekiplerini ve bir salgın durumunda kuş gribi ile enfekte olmuş hastalarla yakın temasta bulunan bireyleri koruyabilir.”

Buna ek olarak, mevcut araştırmanın, gelecekteki herhangi bir evrensel grip aşısı tarafından üretilen bağışıklık korumasını değerlendirmek için yararlı olacak kandaki antikor seviyeleri için test eşiğinin oluşturulmasına da yardımcı olduğunu açıkladı.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.