DNA için “Google”: MetaGraph genetik verileri saniyeler içinde tarıyor…

Nadir genetik hastalıkların tespiti ve tümörlere özgü mutasyonların belirlenmesi artık mümkün. Bu başarı, yıllar önce biyomedikal araştırmalarda devrim yaratan DNA dizileme teknolojileri sayesinde elde edildi. Özellikle son dönemde geliştirilen yeni nesil dizileme (NGS) yöntemleri, genetik araştırmalarda büyük bir veri patlamasına yol açtı.

Amerikan Sequence Read Archive (SRA) ve Avrupa’daki European Nucleotide Archive (ENA) gibi dev veri merkezlerinde artık toplamda yaklaşık 100 petabayt genetik bilgi bulunuyor. Bu miktar, internetteki tüm metin verilerine eşdeğer. Ancak bu kadar büyük bir veriyi aramak bugüne kadar son derece maliyetli ve zaman alıcıydı.

Daha fazlasını oku

Metforminin gizli beyin yolu 60 yıl sonra ortaya çıktı.

Metformin, 60 yılı aşkın süredir tip 2 diyabetin tedavisinde başvurulan ilk ilaç olmasına rağmen, araştırmacılar hala nasıl çalıştığına dair tam bir fikre sahip değiller. Baylor Tıp Fakültesi’ndeki bilim insanları ve uluslararası işbirlikçiler, metforminin klinik açıdan önemli etkilerine aracılık eden, daha önce bilinmeyen yeni bir etken keşfettiler: beyin. Metforminin anti-diyabetik etkisinde rol oynayan bir beyin yolunu ortaya çıkaran araştırmacılar, diyabetin daha etkili ve hassas bir şekilde tedavi edilmesi için yeni olasılıklar keşfettiler. Çalışma, Science Advances dergisinde yayınlandı .

“Metforminin kan şekerini öncelikle karaciğerdeki glikoz çıkışını azaltarak düşürdüğü yaygın olarak kabul görmüştür. Diğer çalışmalar ise bağırsaklar üzerinden etki ettiğini göstermiştir,” diyor Baylor Üniversitesi’nde pediatri ve beslenme alanında doçent olan ilgili yazar Dr. Makoto Fukuda. “Beynin, tüm vücut glikoz metabolizmasının temel düzenleyicisi olarak yaygın olarak kabul edildiği için onu inceledik. Beynin, metforminin anti-diyabetik etkilerine nasıl katkıda bulunduğunu araştırdık.”

Ekip, beynin ventromedial hipotalamus (VMH) olarak bilinen belirli bir bölgesinde bulunan Rap1 adlı küçük bir proteine ​​odaklandı. Araştırmacılar, metforminin klinik açıdan önemli dozlarda kan şekerini düşürme yeteneğinin, bu beyin bölgesindeki Rap1’i kapatmaya bağlı olduğunu keşfetti.

Bunu test etmek için Fukuda laboratuvarı ve meslektaşları, VMH’lerinde Rap1 bulunmayan genetiği değiştirilmiş fareler kullandılar. Bu farelere tip 2 diyabeti taklit etmek için yüksek yağlı bir diyet uygulandı. Düşük dozda metformin verildiğinde, ilaç kan şekerlerini düşürmede başarısız oldu. Ancak insülin ve GLP-1 agonistleri gibi diğer diyabet ilaçları hala işe yarıyordu.

Kaynak ve devamına

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Kanser immünoterapisi için in vivo dendritik hücre yeniden programlaması.

Tümör hücrelerinin cDC1 benzeri hücrelere yeniden programlanmasının, tümör mikroçevresinde tamamen canlı organizmada gerçekleşebileceği hipotezini öne sürüldü. Bu yaklaşım, cDC1’in benzersiz işlevlerinden yararlanarak T hücresi aktivasyonunu destekleyecektir. Singeneik modeller, ksenograftlar ve çeşitli kanser türlerinden elde edilen insan kanser sferoidlerinin bir kombinasyonunu kullanarak, yeniden programlamanın tetiklediği lokal ve sistemik bağışıklık tepkilerini karakterize edildi ve PIB’yi doğrudan tümörlere iletmek için bir viral platform geliştirildi.

In vivo tümör hücresi yeniden programlaması, in vitro yaklaşımlara kıyasla daha hızlı kinetik ve daha yüksek doğruluk gösterdi ve olgun, immünojenik bir imza gösteren tümör yerleşik cDC1 benzeri hücrelerle sonuçlandı. İmmünsüpresif kanser ilişkili fibroblastların, miyeloid kökenli baskılayıcı hücrelerin veya perisitlerin varlığına rağmen insan kanser kürelerinde yeniden programlama etkili bir şekilde ilerledi ve T hücresi aktivasyonuna ve tümör hücresi eliminasyonuna yol açtı.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Yale Araştırmacıları Metabolizmayı Görüntülemek İçin Yeni Bir Platform Geliştiriyor…

Kütle izotopomer çoklu koordinat spektral analizi (MIMOSA), ayrı glikolitik ve mitokondriyal metabolik hızları ölçmek için adım adım bir akı analiz platformudur. Daha da önemlisi, doğrudan sitrat sentez hızları, mitokondriyal asetil-CoA, oksaloasetat ve sitratın pozisyona özgü zenginleştirmeleri için [U-13C6]-D-glikoz etiketlemesinden üretilen kütle spektrumlarının dekonvolüsyonu ile elde edilmiştir 
13C’nin ardışık öncüllerden ürünlerine pozisyona özgü transferinden, önemli metabolik hızların (pirüvat dehidrojenaz, β-oksidasyon, pirüvat karboksilaz, izositrat dehidrojenaz ve PEP/pirüvat döngüsü) kapsamlı sabit durum ve dinamik analizleri hesaplanmıştır. Önceki tekniklerin önemli sınırlamaları belirlenmiştir. INS-1 hücrelerinde sitrat sentaz hızları hem insülin salgılanması hem de oksijen tüketimi ile korelasyon göstermiştir. Pirüvat karboksilaz oranları daha önce bildirilenlerden önemli ölçüde düşüktü, ancak glikoz uyarımına yanıt olarak en yüksek kat değişimi gösterdi. Sonuç olarak, MIMOSA, metabolitler arasında 
13 C etiketinin öncül/ürün pozisyonuna özgü transferinden kaynaklanan temel metabolik hızları ölçer ve glikoz oksitleyen tüm hücrelere geniş bir uygulama alanına sahiptir.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Hücresel pan-zincir asil-CoA profili, mitokondriyal CoA ithalatı ve metabolizmasında SLC25A42/SLC25A16’yı ortaya koyuyor…

Esansiyel kofaktör koenzim A (CoASH) ve tiyoester türevleri (asil-CoA’lar), hücre metabolizmasında önemli rollere sahiptir. Bununla birlikte, farklı asil-CoA’ların, bölgeye özgü reaksiyonları desteklemek için farklı hücre içi bölmelere doğru bir şekilde nasıl bölündüğü ve bu bölmelendirmenin fizyolojik etkisi henüz tam olarak anlaşılamamıştır. Burada, kültürlenmiş insan hücrelerinden 33 hücresel ve 23 mitokondriyal asil-CoA’nın güvenilir bir şekilde tespit edilmesini sağlayan optimize edilmiş bir sıvı kromatografisi-kütle spektrometrisi tabanlı pan-zincir asil-CoA ekstraksiyon ve profilleme yöntemini bildiriyoruz. SLC25A16 ve SLC25A42’nin serbest CoASH’in mitokondriye ithalatı için kritik olduğunu ortaya koyuyoruz. Bu CoASH ithalat süreci, zenginleştirilmiş bir mitokondriyal CoA havuzunu ve yüksek akışlı TCA döngüsü ve yağ asidi oksidasyonu da dahil olmak üzere matristeki CoA’ya bağlı yolları destekler.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Lizozom kusurlarının giderilmesi, Hutchinson-Gilford progeria sendromunun hücresel yaşlanmasını hafifletir…

Hutchinson-Gilford progeria sendromu (HGPS), nadir görülen bir progeroid bozukluğudur ve vakaların yaklaşık %90’ı lamin A/C varyantı progerini üreten LMNA mutasyonundan kaynaklanır. Progerin toksiktir ve temizlenmesi ve bozulması HGPS hücreleri, fareler ve hatta HGPS hastaları üzerinde olumlu faydalar sağlar. Ancak, progerin temizlenmesinin hızlandırılması hala ele alınmamış bir konudur. Burada, HGPS hastalarından alınan birincil hücrelerin lizozom kusurları gösterdiğini ve lizozom biyogenezinin aktivasyonu yoluyla lizozom kusurlarının giderilmesinin progerin temizlenmesini desteklediğini ve buna bağlı olarak HGPS’de hücresel yaşlanmayı hafiflettiğini bildiriyoruz.

Görsel

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Yeni bakteriyel protein, kanser hücrelerinin kendilerini öldürmesine neden olabilir.

İspanyol bilim insanlarının öncülüğünde yürütülen uluslararası bir araştırma, belirli bir bakteri türünün salgıladığı proteinin kanser hücrelerinin kendi kendini yok etmesini sağlayabildiğini ortaya koydu.

Bu keşif, yeni nesil kanser tedavilerinin önünü açabilecek nitelikte.

Söz konusu protein, HapA adıyla biliniyor ve Vibrio cholerae bakterisi tarafından salgılanıyor.

Araştırmanın sonuçları, bilim dergisi Cell Death Discovery’de yayımlandı.

Daha fazlasını oku

Londra’daki doktorlar nadir görülen bir rahatsızlık olan çocuklarda körlüğü tedavi etti…

Dört çocuk artık şekilleri görebiliyor, oyuncakları bulabiliyor, ebeveynlerinin yüzlerini tanıyabiliyor ve bazıları okuyup yazabiliyor.

Londra’daki doktorlar, nadir görülen bir genetik rahatsızlıkla doğan çocuklarda körlüğü, öncü bir gen tedavisi kullanarak tedavi eden dünyadaki ilk doktorlar oldular.

Çocuklarda, AIPL1 genindeki bir kusurdan kaynaklanan görme kaybına neden olan ciddi bir retina distrofisi türü olan leber konjenital amorozis (LCA) vardı. Etkilenenler, yasal olarak doğuştan kör olarak onaylanıyor.

Daha fazlasını oku

Bilim İnsanları Parkinson Proteininin Beyin Hücrelerinde Delikler Açtığını Tespit Etti…

Bilim insanları, Parkinson hastalığının nasıl başlayabileceğine dair endişe verici yeni bir görüntü yakaladı. Zehirli bir proteinin beyin hücrelerinde küçük, titrek delikler açtığı ve onları tamamen yok etmek yerine yavaş yavaş yıprattığı görülüyor.

Daha fazlasını oku

Mikroglia gen aktivitesi Alzheimer evrelerinde değişiyor ve olası tedavi hedeflerini ortaya çıkarıyor.

Alzheimer hastalığı (AH), ilerleyici hafıza kaybına ve zihinsel (yani bilişsel) yeteneklerde gerilemeye neden olan, yıpratıcı bir nörodejeneratif hastalıktır. İstatistikler, her yıl 500.000 ila 900.000 kişiye bu hastalığın teşhisi konulduğunu ve birkaç yüz bin kişinin de bunama veya yaşlanmayla ilişkili diğer bilişsel gerilemeler yaşadığını göstermektedir.

Daha fazlasını oku