Evrimleşme Hızları ve Mozaik Evrim: Her Canlı, Her Özellik, Her Gen Aynı Hızla Evrimleşmez!

Evrimsel değişimlerin bir canlıda her özelliğin aynı anda, topyekün değişmesi gerektiği yönündeki yaygın yanlış anlama, aslında evrimin doğasına aykırıdır. Evrim, yavaş yavaş biriken küçük değişiklikler aracılığıyla işler ve her özellik, çevresel baskılar, genetik çeşitlilik ve doğal seçilimle bağımsız olarak değişebilir. Yani, bir türdeki her özelliğin aynı anda evrimleşmesi gerekmez; farklı özellikler farklı hızlarda, farklı derecelerde ve bağımsız olarak değişebilir.

Bu yanlış anlamanın sebebi, genellikle organizmaların karmaşık yapılarının birbirine bağlı olduğunun fark edilmesinden kaynaklanır. Evet, vücut sistemleri ve organlar çoğu zaman birlikte çalışır ve bu özellikler birbiriyle ilişkili şekilde evrimleşmiş olabilir. Fakat bu, onların her zaman aynı anda değişmesi gerektiği anlamına gelmez. Örneğin, bir organizmanın iskelet sistemi evrimleşirken, kas yapısı ya da dolaşım sistemi de bununla uyumlu olacak şekilde değişiklik gösterebilir, ancak bu değişimlerin her biri kendi zaman çizelgesinde, kendi seçilim baskıları altında gerçekleşir.

Evrim, bu tür değişimlerin kademeli olarak meydana gelmesine izin verir. Dolayısıyla, bir özellik bir değişime uğradığında bu, diğer özelliklerin de aynı anda ve aynı ölçüde değişmesi gerektiği anlamına gelmez. Adaptasyon, çevreye uyum sağlayacak bir dizi küçük, bağımsız değişimin bir araya gelmesiyle meydana gelir. Bu şekilde, bir organizma zamanla çevresine daha iyi uyum sağlayacak nitelikler kazanırken, diğer özellikleri de farklı oranlarda veya farklı yönlerde değişiklik gösterebilir.

Kaynak: Sıradışı bilim sitesinden edinilen bilgi dahilinde yapay zeka ile oluşturulmuş bir yazıdır.

Yaşam evrimleşir. Mineraller de öyle. Peki ya diğer her şey?

Evrimi genişleten önerilen “doğal yasa” destek buldu

Carnegie Bilim Enstitüsü’nde mineralog olan Robert Hazen’a göre Charles Darwin yeterince büyük düşünmemişti. Pencereye bakın, diyor. “Çiçekleri görüyorsunuz. Ağaçları görüyorsunuz. Tüm binaları, inşa ettiğimiz tüm şeyleri, inşa ettiğimiz dili görüyorsunuz.” Zamanla, Dünya’daki her şeyin—sadece canlılar değil—neden giderek daha zengin ve karmaşık göründüğünü ne açıklayabilir?

Geçtiğimiz yıl, Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri’nde yayınlanan bir makalede , Hazen ve Carnegie’de bir astrobiyolog olan Michael Wong liderliğindeki bir ekip bir cevap önerdi . Evrim kavramını genişleten, yalnızca yaşamın değil, mineraloji, kimya ve yıldızların iç işleyişindeki sistemlerin karmaşıklığını artıran eksik bir “doğal yasa” olduğunu söylüyorlar. Geçtiğimiz hafta Wong ve Hazen, mikrobiyolojiden sinirbilime kadar çeşitli 100 bilim insanını, karmaşıklığın nasıl ortaya çıktığı ve evrimleştiği üzerine bir çalıştay için ağırladılar. Ayrıca, Wong’un bir konuşmasında söylediğine göre, “biyoloji dahil ancak bununla sınırlı olmamak üzere, büyük ölçekte fiziksel sistemlerin evrimi için açıklayıcı bir çerçeve” olan cüretkar önerileri için bir referandumdu.

Basitçe ifade etmek gerekirse, makale, çeşitli etkileşimli bileşenlerden oluşan sistemlerin, bazı yapılandırmaların diğerlerinden daha iyi devam etmesine izin veren ortamlara yerleştirildiğinde, kaçınılmaz olarak “artan işlevsel bilgi” durumlarına doğru nasıl ilerleyeceğini açıklıyor. Yani, zaman geçtikçe, bir sistem daha çeşitli ve karmaşık hale gelecek, bir tür doğal seçilim yoluyla hayatta kalmak için gereken işlevlerle zenginleşecektir. DNA mutasyonlarının üreme ve doğal seçilim yoluyla devam eden yapılandırmaları yarattığı biyolojik evrim, bu daha geniş yasanın yalnızca bir alt kümesi olacaktır

.Georgia Teknoloji Enstitüsü’nde yaşamın kökenini inceleyen ve çalıştaya katılan biyokimyacı Loren Williams, bunun çekici bir fikir olduğunu söylüyor. “Bana göre biyolojinin dışında da evrimin olduğu çok açık.” Tüm amino asitlerin omurgasını oluşturan molekül zinciri olan polipeptit omurgasını ele alalım diyor. “[Biyolojik] evrim buna dokunmuyor, değil mi? Canlı olan her şeyde aynıdır. Her zaman böyle olmuştur. Ama bunun bir evrim ürünü olduğuna ikna oldum.” Sadece evrimin yaşam başlamadan önce gerçekleştiğini söylüyor. Ve bu yüzden Hazen ve ortak yazarları kapsamlı teorilerini önerdiklerinde, “bu bende yankı buldu” diyor.

Bu fikrin kökleri, Hazen’in minerallerin evrimini belgelemek için harcadığı yaklaşık 20 yıla dayanır; kayaların kristal yapı taşlarıdır. Dünya tarihi boyunca, başlangıçta sadece birkaç düzineden günümüzde binlercesine evrilmişlerdir. Örneğin, Dünya’nın en erken kalsit formları, meteorların sulu değişimiyle gelişmiştir; mikroplar daha sonra 2,5 milyar yıl önce diğer kalsit yapılarını inşa etmeye başlamışken, salyangozlar ve istiridyeler sadece 100 milyon yıl önce yeni kombinasyonlar yaratmışlardır.

Hazen, 2008 yılında ilk kez bu fikri ortaya attığında meslektaşlarının şüpheci olduğunu söylüyor. “Bu, sadece öylesine bir hikaye gibiydi.” Ancak o zamandan beri, binlerce minerali jeolojik kayıtlarda ilk ortaya çıktıkları tarihlere bağlayan araştırmalar, bunların biyolojideki filogenetik ağaçlar gibi zamanla dallanan bir ağaç oluşturduğunu doğruladı. Disiplin artık belirli değerli veya kritik minerallerin nerede ve ne zaman ortaya çıktığını ve hangi kayalarda ortaya çıktığını belirlemeye başlıyor. Bu gerçek, madencilik endüstrisi tarafından fark edilmeden kalmadı diyor Hazen. “Eski bir deyiş vardır, altın onu bulduğun yerdir,” diyor. “Şimdi ise makine öğrenimi algoritmalarımızın altının nerede olacağını tahmin ettiğini söylüyoruz.”

Mineraller ayrıca Hazen ve Wong’un yeni yasası için en iyi geliştirilmiş vaka çalışmasıdır. Temmuz ayında PNAS Nexus’ta yayınlanan bir makalede , mineral evriminin birden fazla aşamasından geçerek olası mineral kimyasal yapılandırmalarının sayısını hesaplıyorlar ve zamanla, bu minerallerin sayısının durmaksızın arttığını gösteriyorlar – toplam işlevsel bilgilerinde bir büyüme.

Bazı bilim insanları Hazen ve Wong’un fikrini kabul ediyor ancak bunun mutlaka yeni bir doğa yasası haline gelip gelmeyeceğinden emin değiller. Viyana Üniversitesi’nde faaliyet biyolojisini inceleyen bir projeye liderlik eden sistem biyoloğu Johannes Jäger, “Fizikçileri kızdırmamak için buna yeni bir fizik yasası demezdim, ” diyor. Diğerleri ise bunun test edilecek hipotezleri kolayca üretmediğini söylüyor. Uygulamalı Moleküler Evrim Vakfı’nda astrobiyolog olan Elisa Biondi, “Henüz gerçekten kullanamıyoruz,” diyor ve bu fikri beğendiğini vurguluyor. “Kapsamaya çalıştıkları genellik için değil.”

Bununla birlikte, Hazen ve Wong diğer alanlarda taraftar kazanıyor gibi görünüyor. Montpellier Üniversitesi’nde tümör büyümesini inceleyen bir evrimsel biyolog olan Frédéric Thomas, “Makaleyi ilk gördüğümde iki gece uyuyamadım,” diyor. Onları oluşturan hücrelerin ve öldürdükleri hayvanların aksine, tümörler kendileri geleneksel Darwinci evrimi takip etmez: Bir tümör çoğalmaya çalışmaz veya tipik olarak bir organdaki diğer tümörlerle rekabet etmez. Thomas, “Ancak belirli tümörlerin evrimleştiğini ve daha karmaşık ve sofistike hale geldiğini biliyoruz,” diyor. Eylül ayında Evolution, Medicine, & Public Health’de yayınlanan bir çalışmada, Thomas ve meslektaşları tümör evrimini açıklamalarında Hazen ve Wong’dan ödünç alıyorlar .

İkilinin önerisi mikrobiyal ekolojide de benimsendi. Bu yılın başlarında EcoEvoRxiv’de yayınlanan bir ön baskıda, Northern Arizona Üniversitesi’nden Nancy Johnson ve Santo Tomas Üniversitesi’nden César Marín adlı iki mikorizal ekolojist, yerli bitkilerin ve köklerinin, bozulmaya karşı dayanıklılıklarını artırmak için yıldan yıla farklı toprak mikropları ve mantar kombinasyonlarını nasıl seçtiğini açıklamanın bir yolu olarak “işlevsel takım seçimi”ni önermek için fikri uyarladılar. Johnson, “Bu yasa gerçekten gerekli,” diyor. “Benim dünyamda, mikrobiyal ekolojide, çok yardımcı oluyor.”

Google’da teknoloji ve toplum baş teknoloji sorumlusu Blaise Agüera y Arcas, yapay yaşam üzerine bilgisayar bilimi araştırmalarında bile bunun yankılarının olduğunu söylüyor. “Ben buna tamamen katılıyorum,” diyor. “Devam eden şey, var olur.”

Atölye sırasında Agüera y Arcas, ekibinin sanal bir çorbada rastgele bilgisayar talimatı dizileri oluşturmak için minimalist programlama dillerini kullanarak yaptığı çalışmayı sundu ve bu çalışma Ağustos ayında arXiv’de ön baskı olarak yayınlandı. Her turda, iki kod dizisi bir araya getirilir, yürütülür ve parçalanır. Hiçbir mutasyon eklenmez ve ortamda uygunluk baskısı yoktur. İlk başta sonuç hiçbir şey değildi, sadece birleştirilmiş kodlar çalıştırıldığında hatalar ortaya çıktı. Ancak milyonlarca tur boyunca karmaşık kodlar ortaya çıktı; sanki doğal bir evrim yasası iş başındaymış gibi.

Bu karmaşık döngü kod parçacıklarının ne yaptığını anlamak zordu, dedi. “Ama tabii ki yaptıkları şey çoğalmaktı.”

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Fosil buluntusu, Neandertallerin Down sendromlu 6 yaşındaki çocuğa baktığını ortaya koydu.

İspanya’daki bir mağarada bulunan Neandertal çocuğuna ait kulak kemiğinin benzersiz şekli, çocuğun Down sendromuna sahip olduğunu düşündürüyor.

İspanya’daki bir mağarada bulunan tuhaf şekilli kulak kemiğinin yeni analizi, 6 yaşındaki bir Neandertal çocuğunun Down sendromuna sahip olduğunu gösteriyor.

Bulgular, yaklaşık 400.000 ila 40.000 yıl önce Avrasya’da yaşamış en yakın insan akrabalarımız olan Neandertallerde bilinen ilk Down sendromu vakasıdır . Tina lakaplı çocuğun erken çocukluk dönemine kadar yaşaması, Neandertal grubunun ona baktığını ve Neandertallerin fedakar davranışlarda bulunduğunun kanıtını sunmaktadır.

Araştırmacılar, Çarşamba günü (26 Haziran) Science Advances dergisinde yayınlanan yeni bir çalışmada , “Bu çocuğun en az 6 yıl bakıma ihtiyacı olacaktı ve muhtemelen diğer grup üyelerinin anneye çocuk bakımı konusunda yardımcı olması gerekecekti” ifadelerini kullandı.

Kulak kemiği ilk olarak 1989 yılında, Valencia eyaletindeki Xàtiva kasabasında bulunan Cova Negra’da (İspanyolcada “Kara Mağara”) kazılmıştı. Mağaradaki diğer Neandertal kalıntıları 273.000 ila 146.000 yıl öncesine tarihleniyor. Ancak araştırmacılar, kemiğin (bir şakak kemiği parçası) hayvan kalıntılarıyla karıştığını ve yakın zamana kadar tanımlanmadığını söyledi.

Ekip, kemiği taramak için mikro-BT (bilgisayarlı tomografi) kullandı ve bu sayede kemiğin dijital 3 boyutlu modelini oluşturdu. 

Tina’nın kulak kemiğinin Down sendromuyla tutarlı düzensiz bir şekli vardı, ekip buldu. Ayrıca daha küçük bir koklea ve üç kulak kanalının en kısası olan lateral yarım daire kanalında (LSC) anormallikler gibi diğer alışılmadık yönleri de vardı, bir 
açıklamaya göre bunlar birlikte işitme kaybına ve şiddetli baş dönmesine neden olabilir .

Ancak Down sendromlu kişilerde 21. kromozomun fazladan bir kopyası bulunduğundan, Tina’nın gerçekten bu rahatsızlığa sahip olup olmadığını kesin olarak söylemek için genetik bir test yapılması gerekiyor.

Ekip, eğer öyleyse, Tina’nın durumunun gruptaki birden fazla kişinin bakımını gerektirmesi muhtemel olduğunu söyledi.

Neandertallerin sosyal gruplarındaki hasta üyelere baktıkları zaten biliniyordu . Ancak, bakılan bilinen tüm bireyler yetişkinlerdi, bu yüzden Neandertallerin sadece kendilerine karşılık verebilecek olanlara mı baktıkları yoksa bunu fedakarlıktan mı yaptıkları belirsizdi. 

Ekip, zorlu bir genetik rahatsızlığa sahip 6 yaşındaki bir çocuğun karşılığında pek fazla yardım edemeyeceğini göz önünde bulundurarak, ona yardım eden Neandertallerin muhtemelen fedakarlık yaptığını söyledi. “Şimdiye kadar bilinmeyen şey, iyiliği karşılıksız bıraksalar bile yardım alan bir bireyin durumuydu, bu da Neandertaller arasında gerçek bir fedakarlığın varlığını kanıtlayacaktı,” diyor çalışmanın baş yazarı, İspanya’daki Alcalá Üniversitesi’nde profesör olan Mercedes Conde bir açıklamada . “Tina’nın keşfi tam olarak bunu ifade ediyor.”

Bulguların modern insanlar için de sonuçları var.

Araştırmacılar çalışmada, “Hem Neandertallerde hem de kendi türümüzde bu karmaşık sosyal adaptasyonun varlığı, Homo cinsi içinde çok eski bir kökene işaret ediyor” ifadelerini kullandı.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

Ökaryotlar ile Prokaryotlar Arasındaki Kayıp Halka mı Bulundu?

Dünya üzerindeki tüm canlıları sınıflandırmak istersek en geniş küme ökaryotlar ve prokaryotlar şeklinde olur. Bu iki grup birbirlerinden milyonlarca yıl önce ayrıldı, ya da diğer bir deyişle, ökaryotlar prokaryotlardan ayır olarak evrim geçirmeye milyarlarca yıl önce başladı. Bu arada prokaryotlar da kendileri içerisinde bakterilere ve arkelere ayrıldı. Bir süre sonra ise arkeler prokaryotlardan farklı bir grup olarak sınıflandırılmaya başlandı. Bizler, ökaryotlar, arkelere özellikler açısından daha yakınız. Fakat ökaryotların prokaryotlardan nasıl ayrılıp farklı bir evrimsel süreç izlediği ne yazık ki hala merak konusu.

Upsala Üniversitesi’nde Lionel Guy ve Thijs Ettema’nın liderliğini yaptığı bir araştırma ekibi, ökaryotlar ile prokaryotlar arasındaki kayıp halka hakkında bir fikirlerinin olduğunu Mayıs ayının başlarında Nature‘da yayınladıkları makale ile duyurdular. Ekip yıllardır çalıştıkları Arktik Okyanusu’nın derinliklerinden bir miktar DNA kalıntısı çıkardı ve bunu inceledi. Bu DNA’ya sahip olan hücreyi görmemiş olsalar da incelemeler sonucunda bunun bir arkeye ait olduğunu anladılar. Fakat olayı dramatikleştiren tabii ki bu değil. Buldukları arke keşfedilmemiş bir tür ve sadece ökaryotların sahip olduğu bazı genleri DNAlarından bulunduruyorlar. Bu DNAlar sayesinde ise sadece ökaryotların sahip olduğu bazı hücresel özelliklere sahipler.

Dünya üzerindeki tüm canlıları sınıflandırmak istersek en geniş küme ökaryotlar ve prokaryotlar şeklinde olur. Bu iki grup birbirlerinden milyonlarca yıl önce ayrıldı, ya da diğer bir deyişle, ökaryotlar prokaryotlardan ayır olarak evrim geçirmeye milyarlarca yıl önce başladı. Bu arada prokaryotlar da kendileri içerisinde bakterilere ve arkelere ayrıldı. Bir süre sonra ise arkeler prokaryotlardan farklı bir grup olarak sınıflandırılmaya başlandı. Bizler, ökaryotlar, arkelere özellikler açısından daha yakınız. Fakat ökaryotların prokaryotlardan nasıl ayrılıp farklı bir evrimsel süreç izlediği ne yazık ki hala merak konusu.

Upsala Üniversitesi’nde Lionel Guy ve Thijs Ettema’nın liderliğini yaptığı bir araştırma ekibi, ökaryotlar ile prokaryotlar arasındaki kayıp halka hakkında bir fikirlerinin olduğunu Mayıs ayının başlarında Nature‘da yayınladıkları makale ile duyurdular. Ekip yıllardır çalıştıkları Arktik Okyanusu’nın derinliklerinden bir miktar DNA kalıntısı çıkardı ve bunu inceledi. Bu DNA’ya sahip olan hücreyi görmemiş olsalar da incelemeler sonucunda bunun bir arkeye ait olduğunu anladılar. Fakat olayı dramatikleştiren tabii ki bu değil. Buldukları arke keşfedilmemiş bir tür ve sadece ökaryotların sahip olduğu bazı genleri DNAlarından bulunduruyorlar. Bu DNAlar sayesinde ise sadece ökaryotların sahip olduğu bazı hücresel özelliklere sahipler.

Ekip şu an için Loki’nin ökaryotların nasıl evrimleştiğini anlamaya katkıda bulunabileceğini düşünüyor. Ettema’nın Phys.org’a yaptığı açıklamada, “Genom incelemelerini yaptıktan sonra bu yeni organizmanın mikroplar ve gelişmiş ökaryotlar arasında bir yerlerde var olduğunu düşünmeye başladık” diyor. Hatta belki de buldukları bu organizma geçiş basamakları ile doğrudan ilişkilidir. Bu konu üzerinde araştırmalar deva ediyor ve gelişmelerin neler olacağını bize zaman gösterecek. Ancak bu araştırma çoktan tüm bilim insanlarını heyecanlandırmayı başardı.

Kaynak : Ana Kaynak için Tıklayın

Yaşayan En Eski Mikroplar 2 Milyar Yıllık Kayada Bulundu.

Bu organizmalar, bilinen önceki rekor sahiplerinden 1,9 milyar yıl daha eski.

Zeminin yaklaşık 15 metre altındaki mühürlü bir kaya çatlağı, son 2 milyar yıldır mikropların evi olmuş; yani böyle koşullarda keşfedilen en eski yaşama. Yaklaşık 30 santimetre boyutunda olan ve Güney Afrika’daki Bushveld Volkanik Kompleksi’nin altından çıkarılan örnek, önceki mikrobiyal rekor sahiplerinden 1,9 milyar yıl kadar eskiye uzanıyor. Bulgular, araştırmacıların yalnızca Dünya üzerindeki değil, (eğer varsa) Mars üzerindeki evrimsel yaşamın da ilk aşamalarını daha iyi anlamasına yardımcı olabilir.

Üç gün önce Microbial Ecology bülteninde yayımlanan bulgular, Tokyo Üniversitesi Dünya ve Gezegen Bilimleri Bölümünde çalışan ve önceki en eski yaşam biçimlerini 2020 yılında doğrulayan bir araştırma takımından geliyor.

Tokyo Üniversitesi Lisans Üstü Fen Bilimleri Fakültesinde çalışan makale baş yazarı ve yardımcı profesör Yohey Suzuki, Perşembe günü yapılan bir açıklamada “2 milyar yıllık kayaların yaşam barındırabileceğini bilmiyorduk” diyor. “Bu yüzden çok heyecan verici bir keşif oldu.”

Çağlar boyunca yüzeyden gizli kalmış mikropların ortaya çıkarılması için araştırmacıların bir canlının yaş ve kökenini belirlemede kullandığı önceki metodolojileri temel alması gerekmiş. Bunu yaparken de üç tip görüntüleme yaklaşımı (elektron mikroskobisi, floroışıl mikroskobi ve kızılötesi tayfölçümü) birleştirilerek mikrobiyal yaşamın gerçekten bu kadar eski mi olduğu yoksa kazı ve analiz esnasında kazara gerçekleşen bir bulaştan mı geldiği belirlenmeye çalışılmış. Araştırmacılar hücrelerin DNA’sını boyadıktan sonra mikropların proteinlerinin yanısıra etraflarındaki kilden yaşam alanlarına da bakarak, mikropların hem canlı olduklarını hem de çatlaktaki numuneye özgü olduklarını belirlemişler.

Mikropların Dünya üzerindeki neredeyse tüm diğer yaşam biçimlerinden daha uzun süre var olmaya devam edebilmesi, büyük ölçüde yaşam alanlarından kaynaklanıyor olabilir. Güney Afrika’nın kuzeydoğusunda yer alan Bushveld Volkanik Kompleksi, zengin maden yataklarıyla bilinen ve çıkarılan tüm platinin tahmini olarak yüzde 70’ini barındıran, yaklaşık 106.000 kilometre karelik bir bölge. Milyarlarca yıl önce volkanik magma, Dünya’nın yüzeyinin altında 9 km kadar kalın bölgelerde aşamalı biçimde soğumuş.

O zamandan beri çoğunlukla değişmeden kalan bu oluşumlar, mikrobiyal yaşamın yoğun şekilde bulunduğu ufak çatlaklar da barındırıyor. Bununla birlikte kil tortusu, söz konusu çatlakların yakınlarındaki boşlukları kaplamış ve başka hiçbir şeyin girmesine izin vermezken bu küçük canlıları içeride hapsetmiş. Uzmanlar bu durumun, mikrobiyal yaşamın neredeyse hiç evrimsel değişim geçirmeden son derece yavaş bir hızda devam etmesi yönünden istikrar olanağı sağladığını düşünüyor. Araştırma takımı daha fazla keşif yaparak, insanların gelişinden milyarlarca yıl önce gezegenin en eski yaşam formlarından bazılarının neye benzediğini detaylı şekilde öğrenmeyi ümit ediyor.

Gelecekteki çalışmalar Dünya üzerindeki canlıların zamanla nasıl evrimleştiğini daha iyi anlamamızla sınırlı kalmayabilir. Araştırma takımı, ilave keşiflerin günün birinde Mars’ta yaşam bulgusu arayışına da yardımcı olabilmesini umuyor.

Suzuki şöyle açıklıyor: “NASA’nın Perseverance uzay aracı şu an bu çalışmada kullandığımız kayalara benzer bir yaştaki kayaları geri getirmek üzere. Dünya’daki örneklerden mikrobiyal yaşam bulmak… şimdi Mars’taki örneklerde neler bulabileceğimiz bakımından beni heyecanlandırıyor.”

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.

İlk Hayvanlar, Dünya Okyanuslarını Oksijenlendirerek Karmaşık Yaşamın Evrimini Hızlandırmış Olabilir!

Exeter Üniversitesi’nde yapılan yeni araştırma, Dünya’daki karmaşık yaşamın evrimiyle ilgili yaygın bir inanışı sorgulanıyor. Geleneksel olarak atmosferde ve okyanuslarda çözünmüş belli bir miktarda oksijenin kompleks yaşam formlarının evrimi için zorunlu olduğu düşünülüyordu. Ancak bu araştırma, ilk oksijen seviyeleri düşükken bile hayatta kalıp, geçen okyanusları oksijenlendirerek karmaşık evrimini hızlandırabilir.

Bu çalışma, özellikle deniz süngerlerine odaklanıyor. Deniz süngerleri, bilinen en eski hayvan türlerinden biri olarak kabul edilir ve düşük oksijen seviyelerine dayanıklı oldukları bilinmektedir. Araştırmada, Danimarka’daki deniz süngerleri kullanılarak yapılan amplifikasyonlar, bu süngerlerin düşük oksijen koşullarında bile saklanabildiği ve metabolik işlemler sırasında çevrelerdeki suyu filtreleyip oksijen üretebildikleri ortaya konuldu. Bu durum, ilk hayvanların sadece oksijen tüketiminin evrimleşmeyle tanımlanmasıp, aynı zamanda oksijen üretimine katkıda bulunularak daha karmaşık yaşam formlarının evrimi için gerekli koşullar yaratılabileceği belirlenmiştir.

Bu başlangıçlar, ilk hayvanların yaşamları boyunca oksijenin çoğalmasını artırıyor, daha karmaşık organizmaların evrimini hızlandırdığını hayal ediyor. Oksijenin varlığı ve karmaşık yaşamın evrimi arasındaki ilişkinin daha önce düşünüldüğünden çok daha karmaşık olabileceğini ortaya koyan bu çalışma, Dünya’nın erken biyolojik aşamalarında her gün yaşam formlarının gelişip evrimleştiğini söylemek mümkün olabilir.

Kaynak: Sıradışı bilim sitesinden alınan haber yapay zeka ile desteklenmiştir.

Süper bilgisayarlar insan kökeninin sırrını çözüyor

Saniyede 9,6 katrilyon işlem yapabilen bir süper bilgisayar, güney-orta Sibirya’daki Mal’ta yöresinde 24.000 yıl önce ölmüş bir genç erkeğin kemiklerine bakarak, genetiğin en tartışmalı sorularından birini çözdü.

Mevcut genetik modellerine göre, modern Avrupalılar üç farklı grubun DNA’sını taşıyor. Bunlardan ilki Avrupa’ya 40.000 yıl önce ayak basan mavi gözlü, esmer tenli avcı-toplayıcılar. İkincisi, 7.000 yıl kadar önce Yakın Doğu’dan göç eden açık tenli, kahverengi gözlü çiftçiler. “Hayalet popülasyon” olarak bilinen üçüncü ve gizemli bir grup ise daha yakın zamanda Avrupa’ya gelerek genlerini onlarla paylaşmış. Fakat bu grubun kim olduğunu hiç kimse bilmiyor.

Harvard Üniversitesi’nden David Reich ve ekibi, Austin’deki Texas Üniversitesi’nin 9,6 petaflopluk “Stampede” süper bilgisayarına bu ölü gencin genom verisini girerek, üyesi olduğu “tarihi Kuzey Avrasyalılar”ın bu kayıp topluluk olduğunu kanıtladı. Schraiber, Reich ve Harvard’dan meslektaşı Iosif Lazaridif, “hayalet popülasyon”un Amerika yerlilerinkine çok benzeyen DNA dizilerine sahip olduğu bir geçici model kullandıklarında, her şeyin matematiksel bakımdan yerli yerine oturduğunu fark etti.

Aşağı yukarı aynı zamanda, Kopenhag’dan bir bilim insanı ekibi de Mal’talı oğlanın genomuyla ilgili bir makale yayımlayarak onun DNA’sının Amerika yerlilerininkiyle ortak olduğu sonucunu açıkladı. Mal’talı oğlanın DNA’sı modele eklenince eşleştiği görüldü ve sonuçlar Eylül ayında Nature dergisinde yayımlandı.

Buna göre modern Avrupalıların bir kısmının DNA’sı bu Kuzey Avrasyalı gruptan geliyor. Amerikan yerlileriyle de yakın akraba olan bu Kuzey Avrasyalılar, 15.000 yıl önce Amerika ile Avrupa arasındaki buzdan köprüyü aşarak Amerika’ya göç etmiş. Yani bu Kuzey Avrasyalılar günümüz Amerikan yerlilerinin atası olmakla kalmıyor, aynı zamanda modern Avrupalıların DNA’sının da %20’sini oluşturuyor.

Kaynak: https://popsci.com.tr/super-bilgisayarlar-insan-kokeninin-sirrini-cozuyor/

Bilgisayar Bilimi, Matematik ve Evrim: Grafik Teorisi, Doğal Seçilim Yoluyla Evrimin Başarısını Belirlememizi Sağlıyor!

Grafik teorisi ve doğal oluşum arasındaki ilişki, evrimsel biyolojiyi daha iyi anlamamıza yardımcı olur, evrim süreci yalnızca bireysel özellikler üzerinden değil, bölümlerin nasıl organize edildiğine bağlı olarak incelememizi de sağlar.

Doğal oluşum ,grafiksel sistem geliştirme

Grafik Teorisi ve Popülasyonların organize edilmesi

Grafik teorisi nedir?

Grafik teorisi, düğümler (nokta veya insanlar) ve bu düğümleri içeren kenarlardan (bağlantı veya etkileşim) oluşan bir yapıyı inceler. Örneğin, bir sosyal ağda insanlar düğüm, insanlar arasındaki arkadaşlık ilişkileri de kenar olarak mevcuttur. Bu basit araç, karmaşık sistemlerdeki ilişki ağlarını analiz etmek için kullanılır ve bilgisayar bilimi, biyoloji, kolaylık gibi alan

Popülasyonların farklı şekillerde organize olması mümkündür:

  • Yoğun olarak ayrılanlar:
  • Yerel olarak uzaktakiler:
  • Merkezi bağlamalar :

Doğal Seçim ve Grafik Teorisi Arasındaki Etkileşim

Doğal oluşum, yalnızca bireylerin temsilcilerinin uyum sağlama yeteneği değil, aynı zamanda bireylerin aralarındaki etkileşimlerin desteğine de bağlıdır. Grafik boşluklarının, şekillerinin organizasyon biçimlerinin doğal oluşumlarının üzerindeki varlıkların kalıcı olarak incelenmesini sağlar. Örneğin merkezi bireyler diğer bireylerle daha fazla iletişim kurmak için genetik avantajlarlarını daha geniş bir kitleye yayma şansına sahiptir. Buna karşılık, daha az ilişkili kişilerin sonuçları olsalar bile genetik özellikler sınırlı bir alda kalır.

Simül

Grafik sistemi ile yapılan bilgisayar simülasyonları, dağılımın evrimsel olup olmadığı üzerinde daha ayrıntılı bir şekilde inceleme yapmamızı sağlar. Bu ayarlamalar, genetik takvimin belirli bir ağ yapısına bağlı olarak ne kadar hızlı yayılabileceğini veya belirli organizasyonların doğal seçimlerini nasıl hızlandırıp yavaşlatabileceğini gösterir. Bu simülasyonlar sayesinde, bölümlerin uzun vadeli evrimsel parametrelerinin daha iyi kullanılması sağlanır.

Evrimsel Başarının Belirleyicileri

Popülasyonun organizasyon biçimi, doğal oluşum süreçlerini doğrudan etkiler ve evrimsel başarıyı belirler. aralarındaki iletişimlerin yapısı, genetik farklılıkların yayılımını, odakların ayrıntılarını, adaptasyon dağılımını ve genel evrimsel başarıyı etkiler. Grafik teorileri, bu karmaşık etkileşim ağlarını yaygın olarak analiz ederek, evrimsel spektrumların nasıl akışlarını anlamamıza yardımcı oluyor

Kaynak: Sıradışı Bilim sitesinden edinilen bilgiler dahilinde yapay zeka ile oluşturulmuş bir bilgilendirme yazısıdır.

Hayvanlar Isınan Dünyaya Tepki Olarak Şekil Değiştiriyor

Her zamankinden daha hızlı değişen bir iklime yanıt vermek zorunda kalan türlerin adaptasyonlarının buna ayak uydurup uyduramayacağı henüz belirsizliğini koruyor.

AMiya Warrington ve meslektaşlarının Cape yer sincaplarını ( Xerus inauris ) incelediği Güney Afrika doğa koruma alanında , günlük maksimum sıcaklık sadece 18 yılda yaklaşık 2,5 °C arttı. Manitoba Üniversitesi’nde koruma ekolojisti olan Warrington, hayvanların bölgenin boğucu sıcağına dayanmak için bir dizi taktik geliştirdiğini söylüyor. Örneğin, splooting adı verilen bir pozda yere uzanmak, hayvanların daha az tüylü alt kısımlarından ısıyı atmalarına yardımcı oluyor. Sincaplar ayrıca, küçük şemsiyeler gibi başlarının üzerine kıvırdıkları gür kuyruklarının altında gölgeli dinlenme yerleri buluyorlar. Gerçekten sıcak olduğunda, fosil memeliler serinlemek için yuvalarına çekiliyorlar. Ancak Warrington, serinlemek için tüm bu seçeneklere rağmen, bu kadar hızlı bir iklim değişikliği nedeniyle “yine de toleranslarının sınırlarında olabilecekleri” konusunda uyarıyor.

Warrington, bu yoğun baskının vücutlarının şekil değiştirmeye başlamasının nedeni olabileceğini söylüyor. Yaklaşık yirmi yıllık bir süre zarfında sincapların zaten inanılmaz derecede büyük olan ve ısıyı dağıtmaya yardımcı olabilecek arka ayaklarının vücut boyutlarına göre yaklaşık %11 oranında büyüdüğünü buldu. Bu arada, omurga uzunlukları yaklaşık %6 oranında kısaldı.

Ve Cape yer sincabı iklim değişikliğine yanıt olarak şekil değiştiren tek hayvan değil . Bilim insanları birçok türün vücudunun nispeten kısa bir zaman diliminde ince değişiklikler geçirdiğine dair daha fazla kanıt topladıkça, adaptasyonlarının artan sıcaklıkların önünde kalıp kalamayacağı ve bir kırılma noktasına ne kadar yakın olabilecekleri belirsizliğini koruyor.

Küçük bedenler, büyük uzuvlar

1800’lerin sonlarında, iki biyolog, endotermlerin vücutlarının sıcaklığa bağlı olarak enlemlere göre değiştiğine dair ayrı ama ilişkili hipotezler öne sürdü . Bergmann kuralı, daha sıcak tropiklere yakın yaşayan hayvanların daha küçük vücutlar geliştirme eğiliminde olduğunu öne sürerken, Allen kuralı, uzantıların aynı mekansal eğim boyunca daha büyük hale geldiğini öngörür. Her iki durumda da, iki biyolog (kuralların adını aldığı kişiler) ısıyı dağıtmak için termal adaptasyonların bu eğilimleri yönettiğini öne sürdü.

Bir araştırmacı elinde küçük bir mavi kuş tutuyor ve tek tek tüylerini göstermek için bir kanadını açıyor.

Bir bilim insanı , Kuş Popülasyonları Enstitüsü tarafından yürütülen devam eden izleme çalışmalarının bir parçası olarak bir çivit ispinozunu ( Passerina cyanea ) bantlama ve morfolojik ölçümler için hazırlıyor. GRAHAM MONTGOMERY

Michigan State Üniversitesi’nde kantitatif ekolojist olan Casey Youngflesh , “Daha küçük bir birey olduğunuzda, hacim oranına göre daha büyük bir yüzey alanınız olur ve bu da ısıyı daha kolay dağıtmanızı sağlar” diyor. Bergmann kuralı enlemdeki değişiklikleri dikkate alırken, Youngflesh, iklim değişikliğinin Kuzey Amerika’daki bölgelerde daha sıcak hava koşullarına yol açmasıyla kuşların vücut boyutlarının zamansal olarak küçülüp küçülmediğini belirlemeye çalıştı.

105 kuş türünün tüm menzillerine bakan o ve meslektaşları, Kuş Popülasyonları Enstitüsü tarafından derlenen kuş halkalama verilerini taradılar ve üç on yılda 80 türde önemli vücut kütlesi azalmaları buldular . Analiz 250.000’den fazla kuşu içeriyordu ve tüm türler arasında ortalama kütle azalmasının yaklaşık %0,6 olduğunu, ağaç kırlangıçlarının ( Tachycineta bicolor ) yaklaşık %2,8 ile en büyük düşüşü kaydettiğini buldu.

Mutlak sayılar küçük görünse de Youngflesh, evrimsel değişimlerin çoğunun jeolojik zaman ölçeklerine yayıldığını belirtiyor. “Bunun yalnızca 30 yıllık bir dönem olduğunu hatırlamamız gerektiğini düşünüyorum,” diyor. “Ve bu tür değişimleri bu kadar hızlı bir zaman ölçeğinde görmek biraz şok edici.”

Youngflesh’in araştırmasında yer almayan bir ornitolog ve evrimsel biyolog olan Phred Benham da aynı fikirde. “[Onların] projesinin ölçeği muazzam,” diyor ve bu kadar kısa bir süre içinde bu kadar çok türdeki bu değişimi kaydetmenin “gerçekten tüm bu kuşları etkileyen küresel bir şey olduğunu ve mantıklı olanın iklim değişikliği olduğunu” da ekliyor.

“ İklim Değişikliğinin Gelecekteki Mağdurlarının Belirlenmesi ” bölümüne bakın

Youngflesh’in çalışması ayrıca, mutlak kuş kanat uzunluklarının zamanla aynı kalma eğiliminde olmasına rağmen, kuşların küçülen vücutlarına kıyasla nispeten daha uzun hale geldiğini buldu. Ancak Youngflesh, bu artan “kanatlılığın” Allen’ın kuralının önerebileceği gibi ısı dağılımıyla daha az ve mevsimsel göçlerle daha çok ilgisi olduğunu varsayıyor. “Popülasyonlar daha uzağa göç etme eğiliminde olduğunda, daha uzun kanatlara sahip olma eğilimindedirler” diyor ve bu bulgunun kuşların mevsimsel olarak uzun mesafeler uçma yeteneklerini koruma ihtiyacını yansıtabileceğini ekliyor.

Öte yandan, gagaların sıcaklığa bağlı olarak değiştiği görülüyor, diyor daha önce bu olguyu inceleyen Benham. “Daha büyük bir yüzey alanına sahip olmak [kuş gagalarının] daha fazla ısıyı pasif olarak, ek metabolik maliyetler olmadan ve ayrıca buharlaştırıcı soğutmaya güvenmeden dağıtmasına olanak tanır,” diyor ve bunun suyu korumalarına yardımcı olduğunu ekliyor.

Bir Afrika yer sincabı, splooting adı verilen bir pozisyonda yere düz bir şekilde uzanır ve gür kuyruğunu kullanarak vücudunun geri kalanını gölgede bırakır.

Afrika yer sincapları (Xerus inauris ), çeşitli yollarla kendilerini sıcaktan korurlar; bunlardan biri de yere düz bir şekilde uzanarak alt taraflarından ısıyı atmaktır. JANE SU ADAMI

Kaynak ve yazının devamını okumak için tıklayınız: https://www.the-scientist.com/animals-are-shape-shifting-in-response-to-a-warming-world-70869

Evrimsel biyoloji alanında son dönemlerde bazı önemli keşifler yapıldı:

  1. Evrim Daha Az Rastgele Olabilir: 2024 yılında yapılan bir araştırma, evrimin rastgele mutasyonlar yerine daha öngörülebilir yollar izleyebileceğini öne sürdü. Özellikle bakteriler gibi prokaryotlarda genetik değişimlerin zaman içinde düzenli bir şekilde geliştiği gözlemlendi. Bu bulgular, evrimin genel dinamikleri hakkında yeni içgörüler sağlayabilir​(ScienceDaily).
  2. Açlık Düzenlemesinin Evrimsel Kökenleri: Yeni bir çalışma, açlığı düzenleyen bir nöropeptidin iki evrimsel olarak uzak türde paylaşıldığını keşfetti. Bu durum, açlık mekanizmalarının yaşamın en erken evrelerine kadar uzanan antik evrimsel kökleri olabileceğini gösteriyor​(The Scientist).
  3. İklim Değişikliğine Bağlı Hayvanlardaki Fiziksel Değişiklikler: Küresel ısınma ile birlikte bazı hayvanlar “şekil değiştirmeye” başladı. Örneğin, bazı kuşların gagalarının büyüyerek vücut sıcaklıklarını daha iyi düzenleyebildikleri görüldü. Bu, çevresel değişikliklerin evrimsel adaptasyonları doğrudan etkilediğinin bir kanıtı​(The Scientist).

4. Epigenetik ve Evrim: Epigenetik değişikliklerin evrimdeki rolü hala tartışmalı. Ancak, bu tür değişikliklerin nesiller boyunca aktarılabildiğine ve evrimsel süreçlerde önemli bir rol oynayabileceğine dair kanıtlar artıyor. Bu bulgular, genetik kodu değiştirmeyen ancak gen ifadesini etkileyen epigenetik işaretlerin, evrimsel özellikleri nesiller boyunca etkileyebileceğini gösteriyor​(The Scientist).

Kaynak: Bu bilgilendireme notu; Yapay zeka ve google destekli olarak oluşturulmuştur.