Nesli tükenmek üzere olan kuzey beyaz gergedanın genomu, türü canlandırmak için umut sunuyor

Özet:
Kuzey beyaz gergedan, sadece iki dişi kalan ve türlerin üremesi için doğal bir yol olmayan, Dünya’daki en nadir hayvanlardan biridir. Şimdi, bilim adamları kuzey beyaz bir gergedanın tüm genomunu haritaladılar. Bu, gelişmiş üreme teknolojilerini kullanarak kritik tehlike altındaki türleri uçtan geri getirmeye yönelik çok önemli bir adımı temsil ediyor. Tam genom, daha önce geliştirilmiş kuzey beyaz gergedan kök hücrelerinin sağlığını analiz etmek için referans olarak kullanılabilir. Sonunda, bu kök hücreler yeni gergedanlar üretmek için sperm ve yumurta üretebilir.

Kuzey beyaz gergedan, sadece iki dişi kalan ve türlerin üremesi için doğal bir yol olmayan, Dünya’daki en nadir hayvanlardan biridir. Şimdi, Scripps Research, San Diego Hayvanat Bahçesi Yaban Hayatı İttifakı, Max Planck Moleküler Genetik Enstitüsü ve diğer işbirlikçilerden uluslararası bir bilim insanları ekibi, kuzey beyaz bir gergedanın tüm genomunu haritaladı. Bu, gelişmiş üreme teknolojilerini kullanarak kritik tehlike altındaki türleri uçtan geri getirmeye yönelik çok önemli bir adımı temsil ediyor.

Tam genom, daha önce geliştirilmiş kuzey beyaz gergedan kök hücrelerinin sağlığını analiz etmek için referans olarak kullanılabilir. Sonunda, bu kök hücreler yeni gergedanlar üretmek için sperm ve yumurta üretebilir. Genom 13 Mayıs 2025’te PNAS’ta yayınlandı.

Scripps Research’te Emeritus Profesör ve San Diego Hayvanat Bahçesi Yaban Hayatı İttifakı’nda araştırma görevlisi olan yardımcı kıdemli yazar Jeanne Loring, “Bu dönüm noktasıyla ilgili bu kadar heyecan verici olan şey, aksi takdirde yaşamlarımız boyunca nesli tükenebilecek hayvanları kurtarabilmeye yaklaşıyor olmamızdır” diyor. “Bu sadece beyaz gergedanlar için değil, tüm hayvan koruma alanı için büyük bir ilerlemedir.”

Yeni çaba, yüksek kaliteli bir genom oluşturmak için son teknoloji DNA dizilimi ve genom haritalama tekniklerini birleştirdi. Bilim adamları, 2014’teki ölümüne kadar San Diego Hayvanat Bahçesi Safari Parkı’nda yaşayan Angalifu adlı bir erkek kuzey beyaz gergedanından daha önce toplanan hücreleri kullandılar. O zamanlar, cilt hücreleri San Diego Hayvanat Bahçesi Wildlife Alliance’ın Frozen Zoo®’da kriyopreserve edildi.

Loring, “En doğru genomik haritayı mümkün kılmak için birden fazla teknolojiyi bir araya getirdik” diyor. “İnsan Genomu Projesi’nin gergedan versiyonu gibi.”

Bu yeni genom aynı zamanda nesli tükenmekte olan türleri kurtarmak için hayati bir aracı temsil ediyor. 2011 yılında Loring’in ekibi, kuzey beyaz gergedanlardan ilk indüklenmiş pluripotent kök hücreleri yarattı. O zamandan beri, San Diego Hayvanat Bahçesi Yaban Hayatı İttifakı ile işbirliği içinde, dokuz farklı bireysel kuzey beyaz gergedandan başka kök hücre serileri yarattılar. Laboratuvarda yetiştirilen bu hücreler, embriyo oluşturmak için potansiyel olarak kullanılabilecek yumurtalar ve sperm de dahil olmak üzere başka herhangi bir hücre tipi olma yeteneğine sahiptir.

San Diego Hayvanat Bahçesi Yaban Hayatı İttifakı’nda koruma genetiği bilim adamı olan Marisa Korody, “İşbirliği bu dönüm noktasına ulaşmanın ayrılmaz bir parçasıydı” diyor. “Bu yüksek kaliteli referans genomu, kök hücrelerin nasıl çalıştığını anlamamıza yardımcı olan ve genetik kurtarma sürecindeki sonraki adımlarımıza rehberlik eden yapbozun önemli bir parçasıdır. Donmuş Hayvanat Bahçesi ve hücreleri onlarca yıl önce korunmuş gergedanlar olmadan bunların hiçbiri mümkün olmazdı.”

Ancak büyük bir engel her zaman kalite kontrolü olmuştur. Bir referans genomu olmadan, bilim adamları bu kök hücrelerden herhangi birinin laboratuvar büyümesi sırasında zararlı mutasyonlar alıp almadığını bilmiyorlardı – hem insan hem de hayvan kök hücrelerinde yaygın bir sorun. Yeni araştırmada Loring’in ekibi, daha önce oluşturulan kök hücre soylarını analiz etmek için yeni, eksiksiz genomu kullanabildi. Kök hücre hatlarının en umut vericilerinden birinin büyük bir DNA parçasının eksik olduğunu keşfettiler – üreme ve tümör baskılamada yer alanlar da dahil olmak üzere 200’den fazla geni etkileyen 30 milyondan fazla baz çifti.

Loring, “Bu genomu oluşturmasaydık, bunu bilmezdik” diye ekliyor. “İyi bir kök hücre hattımız olduğunu düşündük, ancak üreme için kullanılmasını güvensiz hale getirebilecek bir mutasyona sahip olduğu ortaya çıktı. Şimdi geri dönüp diğerlerini tarayabiliriz. Bu, hangi hücrelerle ilerleneceğine karar vermek için altın standart haline gelir.”

Yeni genom, kuzey ve güney beyaz gergedanlarının gerçekte ne kadar farklı olduğu hakkında kalan soruları da çözdü. Bazı önceki veriler, güney beyaz gergedanlarının kuzey beyaz gergedan embriyolarıyla implante edilmesini riskli hale getirebilecek önemli DNA farklılıklarını öne sürdü. Ancak güncellenmiş karşılaştırmalar, genomlarının çarpıcı bir şekilde benzer olduğunu gösteriyor ve bilim insanlarına çok daha fazla sayıda olan güney beyaz gergedanlarının büyük komplikasyonlar olmadan vekil olarak hizmet edebileceğine dair güven veriyor.

2007’den beri bu proje üzerinde çalışan Loring için yeni genom, neyin mümkün olduğunun bir sembolüdür. “Artık genomlarına sahip olduğumuza göre, insanlar için geliştirdiğimiz tüm araçları – CRISPR gen düzenleme, muhabir genleri, her şey – onları kurtarmaya yardımcı olmak için uygulayabiliriz.”

Loring, çalışmanın diğer nesli tükenmekte olan türler için de güçlü bir örnek teşkil ettiğini söylüyor. Memelilerden ve kuşlardan bitkilere ve mercanlara kadar nesli tükenmekte olan yüzlerce farklı türü kurtarma çabaları, Donmuş Hayvanat Bahçesi tarafından yapılan gibi dikkatli biyobankacılığa bağlıdır.

“Dondurulmuş Hayvanat Bahçesi, bu hayvanlardan gerçek hücreleri dondurmak için bir öngörüye sahipti” diyor. “Bu, eski, hasarlı DNA artıklarından bir türü yeniden yaratmaya çalışmadığımız anlamına geliyor. Gerçek olan bizde.”

Sonuçta amaç, sağlıklı embriyolar yetiştirmek ve onları vekil annelere yerleştirmek, ardından ortaya çıkan buzağıları korunan ortamlarda yetiştirmektir. Bu Jurassic Park değil, Loring hızlı bir şekilde işaret ediyor ve gen düzenleme veya mühendisliğe bağlı değil.

“Gizemli bir türü diriltmiyoruz — hala yakından bildiğimiz bir türü geri yüklüyoruz,” diye ekliyor. “Gergedan büyük, nazik ve unutulmaz. Bilimin yok olmayla savaşmak için yapabilecekleri için mükemmel bir semboldür.”

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsiniz.