Kanser tümörlerini haritalamaya yönelik büyük bir girişim, hastalığın nasıl oluştuğu, geliştiği ve tedavilere karşı direnç geliştirdiği konusunda yeni bilgiler sağlıyor.

Artık çeşitli kanserlerin şimdiye kadar yapılmış en ayrıntılı haritalarından bazılarına ve bunları analiz etmek için yeni araçlara ve yöntemlere sahibiz . Bulgular, 
İnsan Tümör Atlası Ağı adı verilen kanserleri haritalama girişiminden geliyor 
ve kanserlerin nasıl oluştuğu, evrimleştiği ve tedaviye nasıl dirençli hale geldiği hakkında ipuçları sağlıyor.

Kanser, genetik mutasyonların hücrelerin kontrolsüz bir şekilde büyümesine ve çoğalmasına neden olmasıyla gelişir. Hastalık hakkında bildiğimiz şeylerin çoğu tümörleri genetik olarak analiz etmekten gelir. Yakın zamana kadar bunu yalnızca bir tümör örneğindeki tüm genetik verileri bir kerede birleştirerek ve analiz ederek yapabiliyorduk, bu da tek tek hücre tiplerini tanımlamayı imkansız hale getiriyordu.

Ancak tümörler monolitik değildir. Boston’daki Dana-Farber Kanser Enstitüsü’nden Daniel Abravanel , “Sadece tümör hücrelerinden değil, aynı zamanda bağışıklık hücrelerinden, endotel hücrelerinden ve diğer destek hücrelerinden oluşan ekosistemler gibi karmaşıktırlar” diyor.

Daha gelişmiş araçların ortaya çıkması sayesinde, bir araştırmacı ekibi artık 20 farklı kanser türüne sahip yaklaşık 2000 kişiden alınan tümörlerdeki hücreleri tek tek tanımlayabildi veya bunların işlevlerini belirleyebildi.

Çalışmanın bir parçası olarak, St. Louis, Missouri’deki Washington Üniversitesi’nden Li Ding ve meslektaşları, meme, kolon, pankreas, böbrek, rahim ve karaciğer ile safra kesesini ince bağırsağa bağlayan safra kanallarında görülen kanser türlerine sahip 78 kişiden 131 tümör bölgesini haritaladılar . Bir tümör örneğinin her hücresinde hangi genlerin açık veya kapalı olduğunu ölçmek için tek hücre dizilemesi adı verilen bir teknik kullandılar.

Araştırmacılar ayrıca hücrelerin yerini ve yapısını belirlemek için güçlü mikroskoplar altında doku örneklerini incelediler. Daha sonra, tümörlerin 3B modellerini oluşturarak, içindeki hücrelerin nasıl organize olduğunu ve etkileşime girdiğini gösterdiler. Tümörler içinde kanser hücrelerinin mikrobölgeler olarak bilinen belirgin kümeler oluşturduğunu buldular. Araştırmacılar daha sonra bu alanları yüksek veya düşük bağışıklık hücresi aktivitesi gibi benzer genetik değişikliklere göre gruplandırdılar. Mikrobölgelerdeki hücrelerin genetik aktivitesindeki evrim, kanserlerin tedavilere dirençli hale gelmesinde önemli bir faktör gibi görünüyor.

Human Tumor Atlas Network’ten gelen daha ileri araştırmalar, birden fazla hücrenin bazen kolon kanseri oluşturmak için koordine olabileceğini öne sürüyor. Cambridge Üniversitesi’nden Doug Winton , “On yıllardır, alandaki fikir birliği, bir tümörün tek bir hücreden kaynaklandığı yönündeydi” diyor .

Winton ve meslektaşları, hücreleri kanserli hale geldiğinde renk değiştirecek şekilde genetiği değiştirilmiş fareler kullandılar. Bu, hayvanların bağırsaklarında oluşan tümörleri tespit etmeyi ve izlemeyi mümkün kıldı. Araştırmacılar, kolon tümörlerinin yaklaşık %40’ının komşu hücreleri alt etmek için işbirliği yapan birden fazla hücreden kaynaklandığını buldular.

Tennessee’deki Vanderbilt Üniversitesi’nde Ken Lau liderliğindeki ayrı bir araştırmacı grubu da tümör evrimini izlemek için biyobelirteçler tanımladı . Doğal olarak oluşan mutasyonlar dokuda kalıcı genetik değişiklikler yaratır ve bu da araştırmacıların olayların sırasını yeniden yapılandırarak her tümörün büyümesinin moleküler bir zaman çizelgesini oluşturmasına olanak tanır.

Bu yaklaşımı kullanarak farelerde ve insanlarda kolon kanserinin erken öncüllerini analiz ettiler ve bunların %30’unun çok hücreli bir kökene sahip olduğunu buldular. Kolondaki prekanseröz bir lezyonun kanserli olup olmayacağını belirlemek için şu anda sahip olduğumuz en iyi öngörücü, boyutudur, diyor Lau. Kolon kanserinin nasıl oluştuğunu anlamak, prekanseröz lezyonları tarama ve kanseri daha erken tespit etme yeteneğimizi geliştirebilir, diyor.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.