Yazar Kifayet Beşirik

Büyük dil modellerinde metinden SQL’e yeteneklerin değerlendirilmesi için kanalizasyon metagenomik verilerinin kullanıldığı bir vaka çalışması

Büyük dil modellerinde metinden SQL’e yeteneklerin değerlendirilmesi için kanalizasyon metagenomik verilerinin kullanıldığı bir vaka çalışması için yorumlar kapalı

İlişkisel veritabanları, karmaşık veri kümelerini depolamak ve almak için verimli bir çözüm sunar; ancak SQL programlama uzmanlığı gereksinimi, birçok yaşam bilimi kullanıcısı için önemli bir zorluk teşkil eder. Son teknoloji ürünü bir büyük dil modelinin, sade İngilizce sorguları SQL betiklerine (Metinden SQL’e) etkili bir şekilde çevirip çeviremeyeceğini, böylece veritabanı etkileşimini basitleştirip tipik kullanım engellerini ortadan kaldırıp kaldıramayacağını araştırıyoruz. Beş Avrupa şehrinden 239 kanalizasyon örneğinden alınan 19 birbirine bağlı metagenomik analiz tablosundan oluşan karmaşık bir veritabanı mevcuttu. Veritabanının yapısı ve içeriği hakkında arka plan bilgileriyle birlikte büyük bir dil modeli sağlandı.

Daha fazlasını oku

Rahim içi hiperglisemi, cinsiyete özgü epigenetik yeniden programlama müdahalesi yoluyla fare ilkel germ hücresi gelişimini ve doğurganlığını bozar

Rahim içi hiperglisemi, cinsiyete özgü epigenetik yeniden programlama müdahalesi yoluyla fare ilkel germ hücresi gelişimini ve doğurganlığını bozar için yorumlar kapalı ,

Hiperglisemi gibi olumsuz intrauterin ortamlar, eşeyli üremeyi ve tür devamlılığını bozar, ancak altta yatan mekanizmalar hala yeterince anlaşılmamıştır. Bu çalışmada, intrauterin hipergliseminin, özellikle dişi yavrularda, primordial germ hücresi (PGC) gelişimini önemli ölçüde bozduğunu ve böylece doğurganlığı azalttığını gösterdik. Rahim içi hiperglisemiye maruz bırakılan 
Oct4-EGFP transgenik fareleri kullanarak, hipergliseminin PGC gelişimi sırasında cinsel olarak spesifik kromatin erişilebilirliğini ve DNA metilasyon yeniden programlamasını tehlikeye attığını ortaya koyduk

Daha fazlasını oku

Nanosensörler Kalp Krizini Tespit Edebilir Mi?

Nanosensörler Kalp Krizini Tespit Edebilir Mi? için yorumlar kapalı ,

Ülkemizde her yıl 200 bin kişinin hayatını kaybetmesine sebep olan kalp krizi, kalbi besleyen atardamarlarda yaşanan ani tıkanma sonucu kalp kasının yeterli seviyede oksijen alamaması ve buna bağlı olarak kalp dokusunda hasar meydana gelmesidir. Peki kalp krizini gerçekleşmeden önce algılayabilen cihazlar üretilebilir mi?

Daha fazlasını oku

Biyosensörler İçin Güç Kaynağı: Biyobozunur Elektrotlar

Biyosensörler İçin Güç Kaynağı: Biyobozunur Elektrotlar için yorumlar kapalı

Proteus Digital Health adlı şirket, güç kaynağına, sensöre ve vericiye sahip bir hap geliştirdi. Hapı yuttuğunuzda, mide asidiniz pili harekete geçiriyor ve bir sinyal üretilmeye başlıyor. Bu, ilacı gerçekten aldığınızı göstermektedir. Bu ve bunun gibi vücuda yerleştirilen mikroskobik cihazlar ne kadar küçük olsalar da toksik olabilmeleri nedeniyle sağlığımız için zararlı olabilir. Peki bu cihazlar, doğal maddeler kullanılarak elde edilirse insan vücudu için daha az toksik olur mu? Çok küçük boyutlardaki bu cihazlar biyobozunur olabilir mi? Yani biyolojik olarak, vücuttaki sistemlerle ya da bakteriler ve mantarlar gibi mikroorganizmaların biyolojik hareketiyle parçalanabilir mi?

Daha fazlasını oku

Gen İfade Programlama ve Fizik Bilgili Sinir Ağları Kullanılarak Köprü İskelesi Aşınmasının Yorumlanabilir Veri Odaklı Modellenmesi

Gen İfade Programlama ve Fizik Bilgili Sinir Ağları Kullanılarak Köprü İskelesi Aşınmasının Yorumlanabilir Veri Odaklı Modellenmesi için yorumlar kapalı ,

Köprü ayaklarındaki aşınma, normalleştirilmiş aşınma derinliğinin tahminini geliştirmek için gelişmiş makine öğrenimi yaklaşımları kullanılarak araştırıldı. Gen ifadesi programlama (GEP), üç çeşit fizik bilgili sinir ağı (PINN) ve bir temel yapay sinir ağı geliştirildi ve 569 laboratuvar ölçeğinde veri içeren USGS ayak aşınma veritabanı kullanılarak değerlendirildi.

Daha fazlasını oku

Hitler’in DNA’sı incelendi: Hangi bulgulara ulaşıldı, neden tartışılıyor?

Hitler’in DNA’sı incelendi: Hangi bulgulara ulaşıldı, neden tartışılıyor? için yorumlar kapalı

Adolf Hitler’in kanı üzerinde yapılan DNA analizi, diktatörün soyu ve olası sağlık sorunları hakkında bazı önemli bulguları ortaya çıkardı.

Uluslararası uzmanlardan oluşan bir ekip, kan lekesi olan eski bir kumaş parçası üzerinde bilimsel testler yaptı.

Bulgular, Hitler’in Yahudi kökenli olup olmadığına (değildi) ve cinsel organlarının gelişimini etkileyen genetik bir bozukluğu olduğuna dair söylentilere ışık tutmayı başardı.

Tık tuzağı manşetler Nazi diktatörünün mikropenisi ve tek testisi olup olmadığına odaklanmış olsa da, daha ciddi veriler de elde edildi:

Daha fazlasını oku

Entegre biyoenformatik ve deney doğrulaması, sepsis kaynaklı miyokardiyal disfonksiyonda kuproptozla ilişkili biyobelirteçleri ve terapötik hedefleri ortaya koyuyor

Entegre biyoenformatik ve deney doğrulaması, sepsis kaynaklı miyokardiyal disfonksiyonda kuproptozla ilişkili biyobelirteçleri ve terapötik hedefleri ortaya koyuyor için yorumlar kapalı ,

Sepsis kaynaklı miyokard disfonksiyonu (SİMD), yüksek mortaliteye sahip ciddi bir sepsis komplikasyonudur, ancak mevcut tanı ve tedavi yaklaşımları sınırlıdır. Erken dönemde spesifik biyobelirteçlerin ve etkili tedavilerin eksikliği, yeni mekanizmaların araştırılmasını gerektirmektedir. Son zamanlarda kuproptozis çeşitli hastalıklarla ilişkilendirilmiştir, ancak SİMD’deki rolü belirsizdir. Bu çalışma, hayvan modeli doğrulamasıyla desteklenen kuproptozis ile ilişkili biyobelirteçleri ve potansiyel tedavi ajanlarını belirlemeyi amaçlamaktadır.

Daha fazlasını oku

Plazma ekzosomlarının entegre transkriptom profili, kronik pankreatitte ekzokrin ve endokrin bozuklukların moleküler tabakalaşmasını ve S100A8 aracılı hücre etkileşimlerini ortaya koyuyor

Plazma ekzosomlarının entegre transkriptom profili, kronik pankreatitte ekzokrin ve endokrin bozuklukların moleküler tabakalaşmasını ve S100A8 aracılı hücre etkileşimlerini ortaya koyuyor için yorumlar kapalı

Ekzokrin ve endokrin bozukluklar ve yetersizlikler, kronik pankreatitte (CP) iki önemli zararlı patolojik süreçtir ve steatore ve diyabete yol açabilir. Bununla birlikte, CP’de ekzokrin ve endokrin bozuklukların şiddetini değerlendirmek için güvenilir klinik sınıflandırma şemaları eksiktir ve altta yatan mekanizmalar da belirsizdir. Özellikle, CP’de ekzosom bazlı sıvı biyopsi ve sınıflandırma eksiktir. Bu çalışmada, farklı CP şiddet derecelerine sahip CP hastalarından alınan plazma eksozomlarında transkriptom dizilemesi gerçekleştirdik. Ayrıca, sınıflandırmayı yorumlamak için CP hastalarındaki pankreas lezyonlarından alınan tek hücreli dizileme verilerini analiz ettik ve sınıflandırmayı doğrulamak için harici bir kohort oluşturuldu.

Daha fazlasını oku