Toronto Üniversitesi’ndeki araştırmacılar, metabolitleri ölçmek için DNA dizilimi kullanan yeni bir yöntem icat ettiler. Bu, şekerler, vitaminler, hormonlar ve sağlık için kritik olan yüzlerce diğer metabolit gibi biyolojik bileşiklerin hızlı ve hassas bir şekilde analiz edilmesini sağlar.

“Smol-seq” adı verilen küçük molekül dizilimi için yeni platform, metabolitleri tespit etmek için aptamer adı verilen kısa DNA iplikleri kullanıyor. Her aptamer, bir hedef metabolite bağlanacak ve benzersiz bir DNA barkodu taşıyacak şekilde tasarlanmıştır.

“Sağlığımızda oynadıkları rol nedeniyle metabolitleri ölçmemiz gerekiyor, ancak bu geniş molekül yelpazesini incelemek çok zor” diyor U of T’nin Donnelly Hücresel ve Biyomoleküler Araştırma Merkezi’nde çalışmanın ilk yazarı ve araştırma görevlisi June Tan. “Şimdiye kadar, kütle spektrometresi metabolit seviyelerini ölçmek için altın standart olmuştur, ancak DNA’yı sıralayan yöntemler kadar erişilebilir veya hızlı değildir. Bu inanılmaz dizileme gücünden yararlanmak için DNA dizilimi kullanarak metabolitleri tespit eden bir yöntem geliştirmek istedik.”

Çalışma bugün Nature Biotechnology dergisinde yayınlandı.

Bir aptamer hedefine bağlandığında, yapısı DNA barkodunu serbest bırakmak için değişir. Örneğin, glikoz tespit eden aptamer bir barkod serbest bırakır ve stres hormonu kortizolü tanıyan aptamer farklı bir barkod salgılar.

Bu, hangi aptamerlerin hedeflerini sadece serbest bırakılan barkodları sıralayarak bulduğunu söyleyebileceği anlamına gelir. Bir numunede ne kadar fazla metabolit hedefi varsa, o barkodun o kadar fazlası salınır ve araştırmacıların bir karışımdaki farklı moleküllerin konsantrasyonunu ölçmelerine olanak tanır.

Kaynak ve devamına Buradan ulaşabilirsin.